Protein–RNA interactions for Protein: P97386

Lig3, DNA ligase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig3P97386 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lig3P97386 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lig3P97386 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lig3P97386 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lig3P97386 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lig3P97386 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lig3P97386 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lig3P97386 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lig3P97386 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lig3P97386 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lig3P97386 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lig3P97386 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Lig3P97386 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lig3P97386 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lig3P97386 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lig3P97386 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lig3P97386 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lig3P97386 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lig3P97386 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lig3P97386 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lig3P97386 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lig3P97386 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lig3P97386 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lig3P97386 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lig3P97386 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lig3P97386 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lig3P97386 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lig3P97386 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lig3P97386 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lig3P97386 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lig3P97386 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lig3P97386 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lig3P97386 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lig3P97386 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lig3P97386 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lig3P97386 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lig3P97386 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lig3P97386 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lig3P97386 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lig3P97386 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lig3P97386 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lig3P97386 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lig3P97386 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Lig3P97386 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lig3P97386 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lig3P97386 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lig3P97386 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lig3P97386 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lig3P97386 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lig3P97386 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Lig3P97386 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lig3P97386 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lig3P97386 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lig3P97386 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lig3P97386 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lig3P97386 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lig3P97386 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lig3P97386 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lig3P97386 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lig3P97386 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lig3P97386 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lig3P97386 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lig3P97386 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lig3P97386 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lig3P97386 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lig3P97386 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lig3P97386 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lig3P97386 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lig3P97386 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lig3P97386 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Lig3P97386 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lig3P97386 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lig3P97386 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lig3P97386 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lig3P97386 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lig3P97386 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lig3P97386 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lig3P97386 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lig3P97386 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lig3P97386 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lig3P97386 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lig3P97386 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Lig3P97386 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lig3P97386 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lig3P97386 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lig3P97386 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lig3P97386 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lig3P97386 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lig3P97386 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Lig3P97386 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lig3P97386 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lig3P97386 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lig3P97386 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lig3P97386 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lig3P97386 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lig3P97386 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lig3P97386 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lig3P97386 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lig3P97386 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lig3P97386 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms