Protein–RNA interactions for Protein: P70658

Cxcr4, C-X-C chemokine receptor type 4, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr4P70658 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cxcr4P70658 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cxcr4P70658 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cxcr4P70658 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cxcr4P70658 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cxcr4P70658 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cxcr4P70658 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cxcr4P70658 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cxcr4P70658 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cxcr4P70658 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cxcr4P70658 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cxcr4P70658 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cxcr4P70658 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cxcr4P70658 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cxcr4P70658 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cxcr4P70658 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cxcr4P70658 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cxcr4P70658 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cxcr4P70658 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cxcr4P70658 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cxcr4P70658 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cxcr4P70658 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cxcr4P70658 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cxcr4P70658 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cxcr4P70658 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cxcr4P70658 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cxcr4P70658 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cxcr4P70658 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cxcr4P70658 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cxcr4P70658 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cxcr4P70658 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cxcr4P70658 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cxcr4P70658 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cxcr4P70658 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cxcr4P70658 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cxcr4P70658 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cxcr4P70658 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cxcr4P70658 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cxcr4P70658 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cxcr4P70658 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cxcr4P70658 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cxcr4P70658 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cxcr4P70658 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cxcr4P70658 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cxcr4P70658 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cxcr4P70658 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cxcr4P70658 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cxcr4P70658 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cxcr4P70658 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cxcr4P70658 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cxcr4P70658 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cxcr4P70658 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cxcr4P70658 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cxcr4P70658 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cxcr4P70658 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cxcr4P70658 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cxcr4P70658 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cxcr4P70658 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cxcr4P70658 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cxcr4P70658 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cxcr4P70658 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cxcr4P70658 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cxcr4P70658 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cxcr4P70658 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cxcr4P70658 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cxcr4P70658 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cxcr4P70658 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cxcr4P70658 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cxcr4P70658 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cxcr4P70658 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cxcr4P70658 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cxcr4P70658 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cxcr4P70658 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cxcr4P70658 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cxcr4P70658 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cxcr4P70658 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cxcr4P70658 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cxcr4P70658 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cxcr4P70658 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cxcr4P70658 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cxcr4P70658 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cxcr4P70658 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cxcr4P70658 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cxcr4P70658 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cxcr4P70658 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cxcr4P70658 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cxcr4P70658 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cxcr4P70658 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cxcr4P70658 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cxcr4P70658 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cxcr4P70658 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cxcr4P70658 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cxcr4P70658 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cxcr4P70658 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cxcr4P70658 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cxcr4P70658 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cxcr4P70658 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cxcr4P70658 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxcr4P70658 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxcr4P70658 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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