Protein–RNA interactions for Protein: P70362

Ufd1, Ubiquitin recognition factor in ER-associated degradation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufd1P70362 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ufd1P70362 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ufd1P70362 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Ufd1P70362 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ufd1P70362 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ufd1P70362 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ufd1P70362 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ufd1P70362 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Ufd1P70362 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ufd1P70362 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ufd1P70362 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ufd1P70362 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ufd1P70362 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ufd1P70362 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ufd1P70362 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ufd1P70362 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ufd1P70362 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ufd1P70362 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ufd1P70362 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ufd1P70362 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Ufd1P70362 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ufd1P70362 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ufd1P70362 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ufd1P70362 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ufd1P70362 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Ufd1P70362 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Ufd1P70362 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Ufd1P70362 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Ufd1P70362 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Ufd1P70362 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Ufd1P70362 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Ufd1P70362 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ufd1P70362 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ufd1P70362 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Ufd1P70362 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ufd1P70362 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ufd1P70362 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ufd1P70362 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ufd1P70362 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ufd1P70362 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ufd1P70362 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ufd1P70362 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ufd1P70362 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ufd1P70362 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ufd1P70362 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ufd1P70362 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ufd1P70362 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ufd1P70362 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ufd1P70362 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ufd1P70362 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ufd1P70362 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ufd1P70362 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ufd1P70362 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ufd1P70362 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ufd1P70362 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ufd1P70362 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ufd1P70362 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ufd1P70362 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ufd1P70362 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ufd1P70362 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ufd1P70362 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ufd1P70362 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ufd1P70362 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ufd1P70362 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ufd1P70362 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ufd1P70362 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ufd1P70362 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ufd1P70362 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ufd1P70362 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ufd1P70362 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Ufd1P70362 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ufd1P70362 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ufd1P70362 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ufd1P70362 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ufd1P70362 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ufd1P70362 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ufd1P70362 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ufd1P70362 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ufd1P70362 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ufd1P70362 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ufd1P70362 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ufd1P70362 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ufd1P70362 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ufd1P70362 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ufd1P70362 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ufd1P70362 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ufd1P70362 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ufd1P70362 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ufd1P70362 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ufd1P70362 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ufd1P70362 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ufd1P70362 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ufd1P70362 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ufd1P70362 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ufd1P70362 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ufd1P70362 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ufd1P70362 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ufd1P70362 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ufd1P70362 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ufd1P70362 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms