Protein–RNA interactions for Protein: P70278

Stra8, Stimulated by retinoic acid gene 8 protein, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stra8P70278 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Stra8P70278 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Stra8P70278 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Stra8P70278 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Stra8P70278 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Stra8P70278 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Stra8P70278 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Stra8P70278 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Stra8P70278 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Stra8P70278 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Stra8P70278 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Stra8P70278 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Stra8P70278 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Stra8P70278 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Stra8P70278 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Stra8P70278 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Stra8P70278 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Stra8P70278 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Stra8P70278 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Stra8P70278 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Stra8P70278 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Stra8P70278 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Stra8P70278 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Stra8P70278 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Stra8P70278 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Stra8P70278 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Stra8P70278 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Stra8P70278 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Stra8P70278 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Stra8P70278 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Stra8P70278 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Stra8P70278 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Stra8P70278 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Stra8P70278 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Stra8P70278 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Stra8P70278 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Stra8P70278 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Stra8P70278 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Stra8P70278 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Stra8P70278 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Stra8P70278 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Stra8P70278 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Stra8P70278 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Stra8P70278 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Stra8P70278 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Stra8P70278 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Stra8P70278 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Stra8P70278 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Stra8P70278 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Stra8P70278 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Stra8P70278 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Stra8P70278 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Stra8P70278 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Stra8P70278 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Stra8P70278 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Stra8P70278 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Stra8P70278 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Stra8P70278 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Stra8P70278 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Stra8P70278 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Stra8P70278 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Stra8P70278 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Stra8P70278 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Stra8P70278 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Stra8P70278 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Stra8P70278 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Stra8P70278 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Stra8P70278 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Stra8P70278 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Stra8P70278 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Stra8P70278 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Stra8P70278 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Stra8P70278 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Stra8P70278 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Stra8P70278 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Stra8P70278 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Stra8P70278 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Stra8P70278 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Stra8P70278 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Stra8P70278 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Stra8P70278 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Stra8P70278 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Stra8P70278 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Stra8P70278 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Stra8P70278 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Stra8P70278 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Stra8P70278 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Stra8P70278 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Stra8P70278 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Stra8P70278 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Stra8P70278 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Stra8P70278 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Stra8P70278 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Stra8P70278 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Stra8P70278 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Stra8P70278 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Stra8P70278 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Stra8P70278 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Stra8P70278 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Stra8P70278 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms