Protein–RNA interactions for Protein: P70193

Lrig1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig1P70193 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrig1P70193 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrig1P70193 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrig1P70193 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrig1P70193 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrig1P70193 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrig1P70193 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrig1P70193 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrig1P70193 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrig1P70193 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrig1P70193 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrig1P70193 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrig1P70193 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrig1P70193 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrig1P70193 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrig1P70193 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrig1P70193 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrig1P70193 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrig1P70193 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrig1P70193 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrig1P70193 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrig1P70193 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrig1P70193 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrig1P70193 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrig1P70193 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrig1P70193 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrig1P70193 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrig1P70193 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrig1P70193 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrig1P70193 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrig1P70193 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrig1P70193 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrig1P70193 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrig1P70193 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrig1P70193 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrig1P70193 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrig1P70193 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrig1P70193 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrig1P70193 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrig1P70193 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrig1P70193 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrig1P70193 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrig1P70193 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrig1P70193 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrig1P70193 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrig1P70193 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrig1P70193 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrig1P70193 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrig1P70193 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrig1P70193 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrig1P70193 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrig1P70193 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrig1P70193 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrig1P70193 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrig1P70193 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrig1P70193 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrig1P70193 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrig1P70193 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrig1P70193 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrig1P70193 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrig1P70193 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrig1P70193 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrig1P70193 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrig1P70193 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrig1P70193 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrig1P70193 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrig1P70193 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrig1P70193 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrig1P70193 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrig1P70193 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrig1P70193 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrig1P70193 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrig1P70193 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrig1P70193 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrig1P70193 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrig1P70193 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrig1P70193 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrig1P70193 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrig1P70193 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrig1P70193 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrig1P70193 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrig1P70193 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrig1P70193 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrig1P70193 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrig1P70193 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrig1P70193 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrig1P70193 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrig1P70193 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrig1P70193 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrig1P70193 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrig1P70193 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrig1P70193 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrig1P70193 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrig1P70193 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrig1P70193 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrig1P70193 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrig1P70193 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrig1P70193 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrig1P70193 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrig1P70193 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms