Protein–RNA interactions for Protein: P70174

Hrh1, Histamine H1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hrh1P70174 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hrh1P70174 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hrh1P70174 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hrh1P70174 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hrh1P70174 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hrh1P70174 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hrh1P70174 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hrh1P70174 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hrh1P70174 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hrh1P70174 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hrh1P70174 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hrh1P70174 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Hrh1P70174 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hrh1P70174 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hrh1P70174 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hrh1P70174 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hrh1P70174 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hrh1P70174 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hrh1P70174 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hrh1P70174 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hrh1P70174 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hrh1P70174 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hrh1P70174 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hrh1P70174 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hrh1P70174 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hrh1P70174 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hrh1P70174 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hrh1P70174 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hrh1P70174 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hrh1P70174 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hrh1P70174 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hrh1P70174 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hrh1P70174 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hrh1P70174 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hrh1P70174 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hrh1P70174 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hrh1P70174 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hrh1P70174 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hrh1P70174 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hrh1P70174 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hrh1P70174 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hrh1P70174 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hrh1P70174 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Hrh1P70174 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hrh1P70174 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hrh1P70174 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hrh1P70174 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hrh1P70174 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hrh1P70174 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hrh1P70174 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hrh1P70174 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hrh1P70174 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hrh1P70174 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hrh1P70174 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hrh1P70174 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hrh1P70174 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hrh1P70174 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hrh1P70174 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Hrh1P70174 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Hrh1P70174 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Hrh1P70174 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hrh1P70174 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hrh1P70174 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hrh1P70174 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hrh1P70174 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hrh1P70174 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hrh1P70174 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hrh1P70174 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hrh1P70174 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hrh1P70174 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hrh1P70174 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hrh1P70174 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hrh1P70174 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hrh1P70174 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hrh1P70174 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hrh1P70174 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hrh1P70174 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hrh1P70174 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Hrh1P70174 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hrh1P70174 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hrh1P70174 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Hrh1P70174 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hrh1P70174 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hrh1P70174 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hrh1P70174 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hrh1P70174 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hrh1P70174 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hrh1P70174 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hrh1P70174 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hrh1P70174 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hrh1P70174 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Hrh1P70174 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hrh1P70174 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hrh1P70174 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hrh1P70174 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hrh1P70174 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hrh1P70174 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hrh1P70174 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hrh1P70174 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hrh1P70174 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms