Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SbdsP70122 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SbdsP70122 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SbdsP70122 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SbdsP70122 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SbdsP70122 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SbdsP70122 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SbdsP70122 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SbdsP70122 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SbdsP70122 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SbdsP70122 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SbdsP70122 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SbdsP70122 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SbdsP70122 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SbdsP70122 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SbdsP70122 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SbdsP70122 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SbdsP70122 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SbdsP70122 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SbdsP70122 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SbdsP70122 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SbdsP70122 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SbdsP70122 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SbdsP70122 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SbdsP70122 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SbdsP70122 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SbdsP70122 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SbdsP70122 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SbdsP70122 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SbdsP70122 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SbdsP70122 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SbdsP70122 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SbdsP70122 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SbdsP70122 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SbdsP70122 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SbdsP70122 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SbdsP70122 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SbdsP70122 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SbdsP70122 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SbdsP70122 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SbdsP70122 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SbdsP70122 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SbdsP70122 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SbdsP70122 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SbdsP70122 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SbdsP70122 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SbdsP70122 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SbdsP70122 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SbdsP70122 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SbdsP70122 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SbdsP70122 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SbdsP70122 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SbdsP70122 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SbdsP70122 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SbdsP70122 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SbdsP70122 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SbdsP70122 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SbdsP70122 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SbdsP70122 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SbdsP70122 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SbdsP70122 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SbdsP70122 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SbdsP70122 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SbdsP70122 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SbdsP70122 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SbdsP70122 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SbdsP70122 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SbdsP70122 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SbdsP70122 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SbdsP70122 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SbdsP70122 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SbdsP70122 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SbdsP70122 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SbdsP70122 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SbdsP70122 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SbdsP70122 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SbdsP70122 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SbdsP70122 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SbdsP70122 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SbdsP70122 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SbdsP70122 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SbdsP70122 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SbdsP70122 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SbdsP70122 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SbdsP70122 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SbdsP70122 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SbdsP70122 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SbdsP70122 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SbdsP70122 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SbdsP70122 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SbdsP70122 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SbdsP70122 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SbdsP70122 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SbdsP70122 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SbdsP70122 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SbdsP70122 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SbdsP70122 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SbdsP70122 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SbdsP70122 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SbdsP70122 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms