Protein–RNA interactions for Protein: P62821

Rab1A, Ras-related protein Rab-1A, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab1AP62821 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rab1AP62821 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rab1AP62821 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rab1AP62821 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rab1AP62821 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rab1AP62821 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rab1AP62821 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rab1AP62821 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rab1AP62821 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rab1AP62821 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rab1AP62821 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab1AP62821 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab1AP62821 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab1AP62821 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab1AP62821 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab1AP62821 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab1AP62821 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab1AP62821 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab1AP62821 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab1AP62821 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab1AP62821 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab1AP62821 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab1AP62821 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab1AP62821 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab1AP62821 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab1AP62821 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab1AP62821 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab1AP62821 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab1AP62821 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab1AP62821 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab1AP62821 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab1AP62821 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab1AP62821 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab1AP62821 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab1AP62821 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab1AP62821 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab1AP62821 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab1AP62821 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab1AP62821 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab1AP62821 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab1AP62821 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab1AP62821 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab1AP62821 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab1AP62821 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab1AP62821 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab1AP62821 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab1AP62821 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab1AP62821 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab1AP62821 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab1AP62821 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab1AP62821 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab1AP62821 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab1AP62821 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab1AP62821 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab1AP62821 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab1AP62821 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab1AP62821 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab1AP62821 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab1AP62821 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab1AP62821 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab1AP62821 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab1AP62821 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab1AP62821 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab1AP62821 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab1AP62821 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab1AP62821 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab1AP62821 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab1AP62821 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab1AP62821 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab1AP62821 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab1AP62821 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab1AP62821 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab1AP62821 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab1AP62821 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab1AP62821 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab1AP62821 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab1AP62821 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab1AP62821 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab1AP62821 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab1AP62821 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab1AP62821 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab1AP62821 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab1AP62821 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab1AP62821 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab1AP62821 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab1AP62821 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab1AP62821 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab1AP62821 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab1AP62821 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab1AP62821 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab1AP62821 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab1AP62821 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab1AP62821 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab1AP62821 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab1AP62821 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab1AP62821 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab1AP62821 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab1AP62821 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab1AP62821 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab1AP62821 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms