Protein–RNA interactions for Protein: P61759

Vbp1, Prefoldin subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vbp1P61759 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vbp1P61759 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vbp1P61759 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vbp1P61759 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vbp1P61759 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vbp1P61759 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Vbp1P61759 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vbp1P61759 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Vbp1P61759 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vbp1P61759 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vbp1P61759 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vbp1P61759 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vbp1P61759 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vbp1P61759 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vbp1P61759 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vbp1P61759 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vbp1P61759 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Vbp1P61759 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Vbp1P61759 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vbp1P61759 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vbp1P61759 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vbp1P61759 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vbp1P61759 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vbp1P61759 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vbp1P61759 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Vbp1P61759 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vbp1P61759 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vbp1P61759 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vbp1P61759 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Vbp1P61759 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vbp1P61759 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Vbp1P61759 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Vbp1P61759 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vbp1P61759 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Vbp1P61759 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vbp1P61759 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vbp1P61759 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Vbp1P61759 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vbp1P61759 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Vbp1P61759 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vbp1P61759 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vbp1P61759 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vbp1P61759 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Vbp1P61759 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vbp1P61759 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vbp1P61759 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vbp1P61759 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Vbp1P61759 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vbp1P61759 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vbp1P61759 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vbp1P61759 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vbp1P61759 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vbp1P61759 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vbp1P61759 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Vbp1P61759 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vbp1P61759 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vbp1P61759 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vbp1P61759 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vbp1P61759 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vbp1P61759 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vbp1P61759 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vbp1P61759 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Vbp1P61759 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vbp1P61759 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vbp1P61759 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vbp1P61759 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vbp1P61759 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vbp1P61759 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vbp1P61759 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Vbp1P61759 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vbp1P61759 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vbp1P61759 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vbp1P61759 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Vbp1P61759 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Vbp1P61759 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Vbp1P61759 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vbp1P61759 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vbp1P61759 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Vbp1P61759 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vbp1P61759 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vbp1P61759 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Vbp1P61759 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vbp1P61759 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vbp1P61759 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vbp1P61759 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Vbp1P61759 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vbp1P61759 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vbp1P61759 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vbp1P61759 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vbp1P61759 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Vbp1P61759 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vbp1P61759 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Vbp1P61759 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Vbp1P61759 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vbp1P61759 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vbp1P61759 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vbp1P61759 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vbp1P61759 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vbp1P61759 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02■□□□□ -0
Vbp1P61759 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69 ms