Protein–RNA interactions for Protein: P61622

Itga11, Integrin alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga11P61622 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itga11P61622 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itga11P61622 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itga11P61622 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itga11P61622 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itga11P61622 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itga11P61622 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itga11P61622 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itga11P61622 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itga11P61622 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itga11P61622 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Itga11P61622 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itga11P61622 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itga11P61622 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itga11P61622 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itga11P61622 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itga11P61622 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itga11P61622 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Itga11P61622 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itga11P61622 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itga11P61622 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itga11P61622 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itga11P61622 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Itga11P61622 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itga11P61622 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itga11P61622 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itga11P61622 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itga11P61622 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itga11P61622 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itga11P61622 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itga11P61622 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Itga11P61622 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itga11P61622 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itga11P61622 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itga11P61622 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Itga11P61622 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itga11P61622 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Itga11P61622 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itga11P61622 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itga11P61622 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itga11P61622 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itga11P61622 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itga11P61622 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itga11P61622 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itga11P61622 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itga11P61622 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itga11P61622 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itga11P61622 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itga11P61622 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itga11P61622 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itga11P61622 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itga11P61622 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itga11P61622 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itga11P61622 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itga11P61622 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itga11P61622 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itga11P61622 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itga11P61622 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Itga11P61622 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itga11P61622 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itga11P61622 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itga11P61622 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itga11P61622 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itga11P61622 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itga11P61622 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itga11P61622 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itga11P61622 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itga11P61622 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itga11P61622 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itga11P61622 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Itga11P61622 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Itga11P61622 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Itga11P61622 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Itga11P61622 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Itga11P61622 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Itga11P61622 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Itga11P61622 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Itga11P61622 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Itga11P61622 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Itga11P61622 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Itga11P61622 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Itga11P61622 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Itga11P61622 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Itga11P61622 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Itga11P61622 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Itga11P61622 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Itga11P61622 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Itga11P61622 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Itga11P61622 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Itga11P61622 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Itga11P61622 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Itga11P61622 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Itga11P61622 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Itga11P61622 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Itga11P61622 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Itga11P61622 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Itga11P61622 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Itga11P61622 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Itga11P61622 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Itga11P61622 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms