Protein–RNA interactions for Protein: P61264

Stx1b, Syntaxin-1B, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx1bP61264 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stx1bP61264 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stx1bP61264 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stx1bP61264 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stx1bP61264 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx1bP61264 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx1bP61264 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx1bP61264 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx1bP61264 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx1bP61264 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx1bP61264 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx1bP61264 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx1bP61264 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx1bP61264 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx1bP61264 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx1bP61264 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx1bP61264 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx1bP61264 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx1bP61264 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx1bP61264 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx1bP61264 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx1bP61264 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx1bP61264 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx1bP61264 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx1bP61264 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx1bP61264 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx1bP61264 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx1bP61264 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx1bP61264 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx1bP61264 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stx1bP61264 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stx1bP61264 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stx1bP61264 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stx1bP61264 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stx1bP61264 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stx1bP61264 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stx1bP61264 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stx1bP61264 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stx1bP61264 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stx1bP61264 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stx1bP61264 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stx1bP61264 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stx1bP61264 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stx1bP61264 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stx1bP61264 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stx1bP61264 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stx1bP61264 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stx1bP61264 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stx1bP61264 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stx1bP61264 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stx1bP61264 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stx1bP61264 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stx1bP61264 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stx1bP61264 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stx1bP61264 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stx1bP61264 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stx1bP61264 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stx1bP61264 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stx1bP61264 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stx1bP61264 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stx1bP61264 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stx1bP61264 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stx1bP61264 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stx1bP61264 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Stx1bP61264 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stx1bP61264 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stx1bP61264 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stx1bP61264 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stx1bP61264 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stx1bP61264 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stx1bP61264 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stx1bP61264 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stx1bP61264 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stx1bP61264 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stx1bP61264 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stx1bP61264 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stx1bP61264 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stx1bP61264 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stx1bP61264 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stx1bP61264 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stx1bP61264 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stx1bP61264 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stx1bP61264 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stx1bP61264 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stx1bP61264 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stx1bP61264 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stx1bP61264 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stx1bP61264 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stx1bP61264 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stx1bP61264 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stx1bP61264 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stx1bP61264 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stx1bP61264 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stx1bP61264 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stx1bP61264 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stx1bP61264 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stx1bP61264 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stx1bP61264 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Stx1bP61264 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Stx1bP61264 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms