Protein–RNA interactions for Protein: P59222

Scarf2, Scavenger receptor class F member 2, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf2P59222 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Scarf2P59222 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Scarf2P59222 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Scarf2P59222 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Scarf2P59222 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Scarf2P59222 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Scarf2P59222 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Scarf2P59222 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Scarf2P59222 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Scarf2P59222 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Scarf2P59222 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Scarf2P59222 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Scarf2P59222 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Scarf2P59222 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Scarf2P59222 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Scarf2P59222 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Scarf2P59222 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Scarf2P59222 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Scarf2P59222 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Scarf2P59222 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Scarf2P59222 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Scarf2P59222 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Scarf2P59222 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Scarf2P59222 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Scarf2P59222 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Scarf2P59222 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Scarf2P59222 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Scarf2P59222 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Scarf2P59222 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Scarf2P59222 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Scarf2P59222 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Scarf2P59222 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Scarf2P59222 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Scarf2P59222 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Scarf2P59222 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Scarf2P59222 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Scarf2P59222 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Scarf2P59222 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Scarf2P59222 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Scarf2P59222 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Scarf2P59222 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Scarf2P59222 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Scarf2P59222 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Scarf2P59222 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Scarf2P59222 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Scarf2P59222 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Scarf2P59222 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Scarf2P59222 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Scarf2P59222 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Scarf2P59222 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Scarf2P59222 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Scarf2P59222 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Scarf2P59222 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Scarf2P59222 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Scarf2P59222 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Scarf2P59222 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Scarf2P59222 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Scarf2P59222 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Scarf2P59222 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Scarf2P59222 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Scarf2P59222 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Scarf2P59222 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Scarf2P59222 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Scarf2P59222 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Scarf2P59222 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Scarf2P59222 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Scarf2P59222 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Scarf2P59222 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Scarf2P59222 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Scarf2P59222 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Scarf2P59222 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Scarf2P59222 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Scarf2P59222 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Scarf2P59222 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Scarf2P59222 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Scarf2P59222 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Scarf2P59222 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Scarf2P59222 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Scarf2P59222 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Scarf2P59222 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Scarf2P59222 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Scarf2P59222 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Scarf2P59222 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Scarf2P59222 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Scarf2P59222 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Scarf2P59222 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Scarf2P59222 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Scarf2P59222 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Scarf2P59222 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Scarf2P59222 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Scarf2P59222 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Scarf2P59222 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Scarf2P59222 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Scarf2P59222 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Scarf2P59222 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Scarf2P59222 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Scarf2P59222 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Scarf2P59222 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Scarf2P59222 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Scarf2P59222 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms