Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

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Length 1,055 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp25P57080 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp25P57080 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp25P57080 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp25P57080 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp25P57080 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp25P57080 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp25P57080 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp25P57080 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp25P57080 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp25P57080 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp25P57080 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp25P57080 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp25P57080 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp25P57080 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp25P57080 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp25P57080 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp25P57080 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp25P57080 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp25P57080 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp25P57080 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp25P57080 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp25P57080 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp25P57080 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp25P57080 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp25P57080 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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Usp25P57080 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp25P57080 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp25P57080 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp25P57080 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp25P57080 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp25P57080 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp25P57080 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp25P57080 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp25P57080 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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Usp25P57080 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
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Usp25P57080 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp25P57080 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp25P57080 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp25P57080 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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Usp25P57080 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp25P57080 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp25P57080 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp25P57080 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
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Usp25P57080 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp25P57080 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp25P57080 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp25P57080 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp25P57080 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp25P57080 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp25P57080 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp25P57080 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp25P57080 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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Usp25P57080 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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Usp25P57080 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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Usp25P57080 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp25P57080 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp25P57080 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp25P57080 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp25P57080 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp25P57080 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp25P57080 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp25P57080 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp25P57080 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
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Usp25P57080 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp25P57080 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp25P57080 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp25P57080 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp25P57080 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp25P57080 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp25P57080 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp25P57080 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp25P57080 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp25P57080 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp25P57080 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp25P57080 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp25P57080 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp25P57080 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp25P57080 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp25P57080 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp25P57080 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp25P57080 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp25P57080 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp25P57080 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp25P57080 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp25P57080 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
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