Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn18P56857 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn18P56857 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn18P56857 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn18P56857 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn18P56857 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn18P56857 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn18P56857 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn18P56857 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn18P56857 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn18P56857 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn18P56857 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn18P56857 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn18P56857 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn18P56857 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn18P56857 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn18P56857 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn18P56857 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn18P56857 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cldn18P56857 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cldn18P56857 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Cldn18P56857 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cldn18P56857 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cldn18P56857 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cldn18P56857 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cldn18P56857 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cldn18P56857 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cldn18P56857 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cldn18P56857 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cldn18P56857 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn18P56857 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn18P56857 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn18P56857 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn18P56857 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn18P56857 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn18P56857 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn18P56857 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn18P56857 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn18P56857 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn18P56857 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn18P56857 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn18P56857 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn18P56857 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn18P56857 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn18P56857 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn18P56857 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn18P56857 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn18P56857 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn18P56857 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn18P56857 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn18P56857 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn18P56857 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn18P56857 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn18P56857 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn18P56857 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn18P56857 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn18P56857 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn18P56857 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn18P56857 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn18P56857 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn18P56857 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn18P56857 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn18P56857 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn18P56857 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn18P56857 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn18P56857 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn18P56857 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn18P56857 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn18P56857 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn18P56857 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn18P56857 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn18P56857 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn18P56857 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn18P56857 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn18P56857 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn18P56857 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn18P56857 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn18P56857 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn18P56857 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn18P56857 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn18P56857 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn18P56857 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn18P56857 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn18P56857 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn18P56857 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn18P56857 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn18P56857 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn18P56857 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn18P56857 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn18P56857 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn18P56857 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn18P56857 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn18P56857 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn18P56857 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn18P56857 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn18P56857 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn18P56857 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn18P56857 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn18P56857 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn18P56857 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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