Protein–RNA interactions for Protein: P56812

Pdcd5, Programmed cell death protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd5P56812 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdcd5P56812 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdcd5P56812 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdcd5P56812 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdcd5P56812 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdcd5P56812 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdcd5P56812 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdcd5P56812 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdcd5P56812 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdcd5P56812 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdcd5P56812 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdcd5P56812 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdcd5P56812 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdcd5P56812 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdcd5P56812 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdcd5P56812 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdcd5P56812 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdcd5P56812 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdcd5P56812 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdcd5P56812 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdcd5P56812 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdcd5P56812 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdcd5P56812 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdcd5P56812 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdcd5P56812 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdcd5P56812 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdcd5P56812 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdcd5P56812 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdcd5P56812 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdcd5P56812 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdcd5P56812 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdcd5P56812 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdcd5P56812 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdcd5P56812 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdcd5P56812 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdcd5P56812 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdcd5P56812 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdcd5P56812 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdcd5P56812 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pdcd5P56812 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pdcd5P56812 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pdcd5P56812 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pdcd5P56812 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pdcd5P56812 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pdcd5P56812 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pdcd5P56812 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pdcd5P56812 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdcd5P56812 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdcd5P56812 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdcd5P56812 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdcd5P56812 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdcd5P56812 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdcd5P56812 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdcd5P56812 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdcd5P56812 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdcd5P56812 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdcd5P56812 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdcd5P56812 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdcd5P56812 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdcd5P56812 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdcd5P56812 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdcd5P56812 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdcd5P56812 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdcd5P56812 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdcd5P56812 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdcd5P56812 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdcd5P56812 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdcd5P56812 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdcd5P56812 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdcd5P56812 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdcd5P56812 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdcd5P56812 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdcd5P56812 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdcd5P56812 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdcd5P56812 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdcd5P56812 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdcd5P56812 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdcd5P56812 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdcd5P56812 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdcd5P56812 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdcd5P56812 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdcd5P56812 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdcd5P56812 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdcd5P56812 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdcd5P56812 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdcd5P56812 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdcd5P56812 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdcd5P56812 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdcd5P56812 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdcd5P56812 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdcd5P56812 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdcd5P56812 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdcd5P56812 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdcd5P56812 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdcd5P56812 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdcd5P56812 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdcd5P56812 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdcd5P56812 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdcd5P56812 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdcd5P56812 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms