Protein–RNA interactions for Protein: P56481

Cckbr, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CckbrP56481 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CckbrP56481 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CckbrP56481 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CckbrP56481 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CckbrP56481 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CckbrP56481 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CckbrP56481 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CckbrP56481 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CckbrP56481 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CckbrP56481 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CckbrP56481 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CckbrP56481 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CckbrP56481 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CckbrP56481 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CckbrP56481 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CckbrP56481 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CckbrP56481 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CckbrP56481 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CckbrP56481 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CckbrP56481 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CckbrP56481 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CckbrP56481 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CckbrP56481 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CckbrP56481 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CckbrP56481 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CckbrP56481 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CckbrP56481 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CckbrP56481 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CckbrP56481 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CckbrP56481 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CckbrP56481 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CckbrP56481 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CckbrP56481 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CckbrP56481 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CckbrP56481 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CckbrP56481 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CckbrP56481 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CckbrP56481 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CckbrP56481 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CckbrP56481 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CckbrP56481 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CckbrP56481 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CckbrP56481 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CckbrP56481 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CckbrP56481 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CckbrP56481 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CckbrP56481 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CckbrP56481 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CckbrP56481 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CckbrP56481 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CckbrP56481 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CckbrP56481 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CckbrP56481 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CckbrP56481 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CckbrP56481 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CckbrP56481 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CckbrP56481 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CckbrP56481 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CckbrP56481 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CckbrP56481 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CckbrP56481 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CckbrP56481 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CckbrP56481 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
CckbrP56481 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CckbrP56481 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CckbrP56481 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CckbrP56481 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CckbrP56481 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CckbrP56481 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CckbrP56481 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CckbrP56481 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CckbrP56481 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CckbrP56481 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CckbrP56481 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CckbrP56481 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CckbrP56481 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CckbrP56481 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CckbrP56481 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CckbrP56481 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CckbrP56481 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CckbrP56481 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CckbrP56481 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CckbrP56481 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CckbrP56481 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CckbrP56481 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CckbrP56481 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CckbrP56481 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CckbrP56481 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CckbrP56481 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CckbrP56481 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CckbrP56481 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CckbrP56481 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CckbrP56481 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CckbrP56481 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CckbrP56481 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CckbrP56481 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CckbrP56481 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CckbrP56481 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CckbrP56481 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CckbrP56481 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms