Protein–RNA interactions for Protein: P56394

Cox17, Cytochrome c oxidase copper chaperone, mousemouse

Predictions only

Length 63 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox17P56394 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cox17P56394 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cox17P56394 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cox17P56394 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cox17P56394 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cox17P56394 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Cox17P56394 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Cox17P56394 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cox17P56394 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cox17P56394 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cox17P56394 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cox17P56394 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cox17P56394 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cox17P56394 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cox17P56394 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cox17P56394 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cox17P56394 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cox17P56394 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cox17P56394 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cox17P56394 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cox17P56394 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cox17P56394 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cox17P56394 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Cox17P56394 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cox17P56394 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cox17P56394 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cox17P56394 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cox17P56394 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cox17P56394 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cox17P56394 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cox17P56394 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cox17P56394 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cox17P56394 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cox17P56394 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cox17P56394 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cox17P56394 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cox17P56394 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Cox17P56394 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Cox17P56394 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cox17P56394 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cox17P56394 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cox17P56394 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cox17P56394 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cox17P56394 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Cox17P56394 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cox17P56394 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cox17P56394 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cox17P56394 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cox17P56394 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cox17P56394 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cox17P56394 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cox17P56394 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cox17P56394 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Cox17P56394 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cox17P56394 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cox17P56394 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cox17P56394 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cox17P56394 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cox17P56394 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cox17P56394 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cox17P56394 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Cox17P56394 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cox17P56394 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cox17P56394 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cox17P56394 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cox17P56394 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cox17P56394 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cox17P56394 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cox17P56394 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cox17P56394 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Cox17P56394 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cox17P56394 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cox17P56394 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cox17P56394 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cox17P56394 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cox17P56394 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cox17P56394 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cox17P56394 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cox17P56394 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cox17P56394 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cox17P56394 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cox17P56394 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cox17P56394 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Cox17P56394 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cox17P56394 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Cox17P56394 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cox17P56394 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cox17P56394 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cox17P56394 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cox17P56394 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cox17P56394 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cox17P56394 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cox17P56394 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cox17P56394 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cox17P56394 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cox17P56394 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cox17P56394 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cox17P56394 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cox17P56394 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cox17P56394 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms