Protein–RNA interactions for Protein: P55284

Cdh5, Cadherin-5, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh5P55284 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdh5P55284 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdh5P55284 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdh5P55284 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdh5P55284 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdh5P55284 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdh5P55284 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdh5P55284 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdh5P55284 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdh5P55284 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdh5P55284 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdh5P55284 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdh5P55284 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdh5P55284 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdh5P55284 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdh5P55284 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdh5P55284 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdh5P55284 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdh5P55284 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdh5P55284 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdh5P55284 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdh5P55284 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdh5P55284 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdh5P55284 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdh5P55284 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdh5P55284 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdh5P55284 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdh5P55284 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdh5P55284 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdh5P55284 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdh5P55284 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdh5P55284 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdh5P55284 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdh5P55284 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdh5P55284 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdh5P55284 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdh5P55284 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdh5P55284 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdh5P55284 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdh5P55284 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdh5P55284 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdh5P55284 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdh5P55284 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdh5P55284 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdh5P55284 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdh5P55284 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdh5P55284 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdh5P55284 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdh5P55284 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdh5P55284 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdh5P55284 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdh5P55284 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdh5P55284 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdh5P55284 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cdh5P55284 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cdh5P55284 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cdh5P55284 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cdh5P55284 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cdh5P55284 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cdh5P55284 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cdh5P55284 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cdh5P55284 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cdh5P55284 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdh5P55284 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdh5P55284 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdh5P55284 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdh5P55284 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdh5P55284 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdh5P55284 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdh5P55284 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdh5P55284 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdh5P55284 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdh5P55284 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdh5P55284 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdh5P55284 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdh5P55284 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdh5P55284 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdh5P55284 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdh5P55284 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdh5P55284 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdh5P55284 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdh5P55284 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdh5P55284 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdh5P55284 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdh5P55284 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdh5P55284 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdh5P55284 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdh5P55284 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdh5P55284 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdh5P55284 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdh5P55284 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdh5P55284 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdh5P55284 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdh5P55284 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdh5P55284 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdh5P55284 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdh5P55284 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdh5P55284 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdh5P55284 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdh5P55284 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.3 ms