Protein–RNA interactions for Protein: P54099

Polg, DNA polymerase subunit gamma-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolgP54099 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PolgP54099 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PolgP54099 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PolgP54099 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PolgP54099 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PolgP54099 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PolgP54099 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PolgP54099 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PolgP54099 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PolgP54099 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PolgP54099 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PolgP54099 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PolgP54099 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PolgP54099 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PolgP54099 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PolgP54099 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PolgP54099 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PolgP54099 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PolgP54099 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PolgP54099 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PolgP54099 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PolgP54099 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PolgP54099 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PolgP54099 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PolgP54099 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PolgP54099 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PolgP54099 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PolgP54099 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PolgP54099 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PolgP54099 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PolgP54099 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PolgP54099 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PolgP54099 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PolgP54099 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PolgP54099 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PolgP54099 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PolgP54099 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PolgP54099 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PolgP54099 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PolgP54099 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PolgP54099 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PolgP54099 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PolgP54099 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PolgP54099 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PolgP54099 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PolgP54099 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PolgP54099 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PolgP54099 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PolgP54099 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PolgP54099 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PolgP54099 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PolgP54099 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PolgP54099 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PolgP54099 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PolgP54099 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PolgP54099 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PolgP54099 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PolgP54099 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PolgP54099 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PolgP54099 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PolgP54099 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PolgP54099 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PolgP54099 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PolgP54099 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PolgP54099 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PolgP54099 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PolgP54099 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PolgP54099 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PolgP54099 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PolgP54099 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PolgP54099 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PolgP54099 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PolgP54099 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PolgP54099 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PolgP54099 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PolgP54099 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PolgP54099 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PolgP54099 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PolgP54099 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PolgP54099 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PolgP54099 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PolgP54099 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PolgP54099 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PolgP54099 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PolgP54099 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PolgP54099 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PolgP54099 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PolgP54099 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PolgP54099 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PolgP54099 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PolgP54099 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PolgP54099 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PolgP54099 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PolgP54099 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PolgP54099 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PolgP54099 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PolgP54099 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PolgP54099 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PolgP54099 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PolgP54099 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms