Protein–RNA interactions for Protein: P52955

Lbx1, Transcription factor LBX1, mousemouse

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Length 282 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lbx1P52955 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lbx1P52955 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lbx1P52955 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lbx1P52955 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lbx1P52955 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lbx1P52955 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Lbx1P52955 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lbx1P52955 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lbx1P52955 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lbx1P52955 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lbx1P52955 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lbx1P52955 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Lbx1P52955 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lbx1P52955 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lbx1P52955 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lbx1P52955 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Lbx1P52955 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lbx1P52955 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lbx1P52955 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lbx1P52955 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lbx1P52955 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lbx1P52955 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lbx1P52955 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lbx1P52955 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lbx1P52955 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Lbx1P52955 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lbx1P52955 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lbx1P52955 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lbx1P52955 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lbx1P52955 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lbx1P52955 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lbx1P52955 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lbx1P52955 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Lbx1P52955 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lbx1P52955 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lbx1P52955 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lbx1P52955 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lbx1P52955 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lbx1P52955 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lbx1P52955 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lbx1P52955 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lbx1P52955 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lbx1P52955 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lbx1P52955 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lbx1P52955 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Lbx1P52955 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lbx1P52955 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lbx1P52955 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lbx1P52955 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lbx1P52955 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lbx1P52955 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lbx1P52955 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lbx1P52955 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lbx1P52955 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lbx1P52955 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lbx1P52955 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lbx1P52955 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Lbx1P52955 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lbx1P52955 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lbx1P52955 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lbx1P52955 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lbx1P52955 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lbx1P52955 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lbx1P52955 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lbx1P52955 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lbx1P52955 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lbx1P52955 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lbx1P52955 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lbx1P52955 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lbx1P52955 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lbx1P52955 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lbx1P52955 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lbx1P52955 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lbx1P52955 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Lbx1P52955 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lbx1P52955 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Lbx1P52955 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Lbx1P52955 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lbx1P52955 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lbx1P52955 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lbx1P52955 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lbx1P52955 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lbx1P52955 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lbx1P52955 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lbx1P52955 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lbx1P52955 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lbx1P52955 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lbx1P52955 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lbx1P52955 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lbx1P52955 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lbx1P52955 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lbx1P52955 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lbx1P52955 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lbx1P52955 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lbx1P52955 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lbx1P52955 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lbx1P52955 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lbx1P52955 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lbx1P52955 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lbx1P52955 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms