Protein–RNA interactions for Protein: P52483

Ube2e3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e3P52483 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ube2e3P52483 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ube2e3P52483 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ube2e3P52483 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ube2e3P52483 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ube2e3P52483 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ube2e3P52483 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ube2e3P52483 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ube2e3P52483 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ube2e3P52483 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ube2e3P52483 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ube2e3P52483 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ube2e3P52483 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ube2e3P52483 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ube2e3P52483 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ube2e3P52483 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ube2e3P52483 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ube2e3P52483 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ube2e3P52483 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ube2e3P52483 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ube2e3P52483 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ube2e3P52483 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ube2e3P52483 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ube2e3P52483 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ube2e3P52483 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ube2e3P52483 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ube2e3P52483 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ube2e3P52483 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ube2e3P52483 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ube2e3P52483 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ube2e3P52483 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ube2e3P52483 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ube2e3P52483 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ube2e3P52483 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ube2e3P52483 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ube2e3P52483 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ube2e3P52483 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ube2e3P52483 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ube2e3P52483 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ube2e3P52483 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ube2e3P52483 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ube2e3P52483 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ube2e3P52483 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ube2e3P52483 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ube2e3P52483 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ube2e3P52483 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ube2e3P52483 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ube2e3P52483 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ube2e3P52483 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ube2e3P52483 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ube2e3P52483 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ube2e3P52483 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ube2e3P52483 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ube2e3P52483 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ube2e3P52483 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ube2e3P52483 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ube2e3P52483 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ube2e3P52483 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ube2e3P52483 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ube2e3P52483 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ube2e3P52483 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ube2e3P52483 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ube2e3P52483 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ube2e3P52483 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ube2e3P52483 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ube2e3P52483 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ube2e3P52483 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ube2e3P52483 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ube2e3P52483 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ube2e3P52483 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ube2e3P52483 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ube2e3P52483 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ube2e3P52483 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ube2e3P52483 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ube2e3P52483 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ube2e3P52483 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ube2e3P52483 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ube2e3P52483 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ube2e3P52483 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ube2e3P52483 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ube2e3P52483 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ube2e3P52483 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ube2e3P52483 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ube2e3P52483 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ube2e3P52483 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ube2e3P52483 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ube2e3P52483 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ube2e3P52483 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ube2e3P52483 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ube2e3P52483 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ube2e3P52483 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ube2e3P52483 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ube2e3P52483 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ube2e3P52483 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ube2e3P52483 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ube2e3P52483 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ube2e3P52483 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ube2e3P52483 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ube2e3P52483 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ube2e3P52483 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms