Protein–RNA interactions for Protein: P51885

Lum, Lumican, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LumP51885 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LumP51885 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LumP51885 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LumP51885 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LumP51885 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LumP51885 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LumP51885 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LumP51885 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LumP51885 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LumP51885 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LumP51885 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LumP51885 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LumP51885 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LumP51885 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LumP51885 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LumP51885 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LumP51885 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LumP51885 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LumP51885 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LumP51885 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LumP51885 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LumP51885 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LumP51885 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LumP51885 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LumP51885 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LumP51885 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LumP51885 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LumP51885 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LumP51885 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LumP51885 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LumP51885 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LumP51885 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LumP51885 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LumP51885 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LumP51885 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LumP51885 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LumP51885 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LumP51885 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LumP51885 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LumP51885 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LumP51885 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LumP51885 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LumP51885 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LumP51885 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LumP51885 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LumP51885 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LumP51885 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LumP51885 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LumP51885 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LumP51885 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LumP51885 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LumP51885 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LumP51885 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LumP51885 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LumP51885 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LumP51885 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LumP51885 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LumP51885 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LumP51885 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LumP51885 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LumP51885 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LumP51885 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LumP51885 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LumP51885 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LumP51885 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LumP51885 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LumP51885 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LumP51885 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LumP51885 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LumP51885 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LumP51885 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LumP51885 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LumP51885 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LumP51885 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LumP51885 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LumP51885 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LumP51885 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LumP51885 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LumP51885 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LumP51885 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LumP51885 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LumP51885 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LumP51885 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LumP51885 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LumP51885 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LumP51885 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LumP51885 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LumP51885 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LumP51885 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LumP51885 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LumP51885 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LumP51885 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LumP51885 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LumP51885 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LumP51885 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LumP51885 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LumP51885 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LumP51885 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LumP51885 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LumP51885 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms