Protein–RNA interactions for Protein: P51680

Ccr4, C-C chemokine receptor type 4, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr4P51680 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccr4P51680 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccr4P51680 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccr4P51680 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccr4P51680 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccr4P51680 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccr4P51680 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccr4P51680 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccr4P51680 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccr4P51680 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccr4P51680 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccr4P51680 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccr4P51680 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccr4P51680 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccr4P51680 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccr4P51680 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccr4P51680 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccr4P51680 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccr4P51680 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccr4P51680 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccr4P51680 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccr4P51680 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccr4P51680 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccr4P51680 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccr4P51680 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccr4P51680 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccr4P51680 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccr4P51680 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccr4P51680 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccr4P51680 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccr4P51680 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccr4P51680 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccr4P51680 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccr4P51680 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccr4P51680 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccr4P51680 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccr4P51680 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccr4P51680 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccr4P51680 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccr4P51680 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccr4P51680 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccr4P51680 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccr4P51680 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccr4P51680 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccr4P51680 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccr4P51680 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccr4P51680 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccr4P51680 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccr4P51680 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccr4P51680 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccr4P51680 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccr4P51680 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccr4P51680 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccr4P51680 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccr4P51680 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccr4P51680 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccr4P51680 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccr4P51680 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccr4P51680 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccr4P51680 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccr4P51680 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccr4P51680 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccr4P51680 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccr4P51680 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccr4P51680 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccr4P51680 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccr4P51680 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccr4P51680 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccr4P51680 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccr4P51680 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccr4P51680 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccr4P51680 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccr4P51680 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccr4P51680 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccr4P51680 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccr4P51680 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccr4P51680 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccr4P51680 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccr4P51680 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccr4P51680 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccr4P51680 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccr4P51680 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccr4P51680 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccr4P51680 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccr4P51680 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccr4P51680 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccr4P51680 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccr4P51680 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccr4P51680 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccr4P51680 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccr4P51680 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccr4P51680 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccr4P51680 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccr4P51680 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccr4P51680 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccr4P51680 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccr4P51680 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccr4P51680 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccr4P51680 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccr4P51680 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms