Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TspoP50637 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TspoP50637 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TspoP50637 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TspoP50637 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TspoP50637 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TspoP50637 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TspoP50637 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TspoP50637 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
TspoP50637 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TspoP50637 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TspoP50637 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TspoP50637 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TspoP50637 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TspoP50637 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TspoP50637 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TspoP50637 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TspoP50637 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TspoP50637 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TspoP50637 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TspoP50637 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
TspoP50637 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TspoP50637 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TspoP50637 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TspoP50637 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TspoP50637 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TspoP50637 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TspoP50637 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TspoP50637 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TspoP50637 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TspoP50637 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TspoP50637 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
TspoP50637 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TspoP50637 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
TspoP50637 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TspoP50637 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TspoP50637 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TspoP50637 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
TspoP50637 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
TspoP50637 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TspoP50637 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TspoP50637 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TspoP50637 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TspoP50637 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TspoP50637 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TspoP50637 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TspoP50637 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TspoP50637 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TspoP50637 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TspoP50637 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
TspoP50637 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TspoP50637 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TspoP50637 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TspoP50637 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TspoP50637 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TspoP50637 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TspoP50637 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TspoP50637 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TspoP50637 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TspoP50637 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TspoP50637 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TspoP50637 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TspoP50637 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TspoP50637 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TspoP50637 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
TspoP50637 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
TspoP50637 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TspoP50637 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TspoP50637 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TspoP50637 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TspoP50637 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TspoP50637 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TspoP50637 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TspoP50637 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TspoP50637 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TspoP50637 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TspoP50637 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TspoP50637 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TspoP50637 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TspoP50637 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
TspoP50637 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TspoP50637 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TspoP50637 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TspoP50637 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TspoP50637 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
TspoP50637 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TspoP50637 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TspoP50637 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
TspoP50637 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TspoP50637 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TspoP50637 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TspoP50637 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TspoP50637 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TspoP50637 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TspoP50637 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TspoP50637 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TspoP50637 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TspoP50637 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TspoP50637 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TspoP50637 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms