Protein–RNA interactions for Protein: P50608

Fmod, Fibromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FmodP50608 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FmodP50608 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FmodP50608 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FmodP50608 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FmodP50608 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FmodP50608 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FmodP50608 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FmodP50608 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FmodP50608 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FmodP50608 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FmodP50608 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FmodP50608 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FmodP50608 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
FmodP50608 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FmodP50608 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FmodP50608 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FmodP50608 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FmodP50608 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FmodP50608 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FmodP50608 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
FmodP50608 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FmodP50608 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FmodP50608 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FmodP50608 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FmodP50608 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
FmodP50608 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FmodP50608 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FmodP50608 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FmodP50608 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FmodP50608 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FmodP50608 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FmodP50608 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FmodP50608 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FmodP50608 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FmodP50608 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FmodP50608 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FmodP50608 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FmodP50608 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FmodP50608 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FmodP50608 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FmodP50608 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FmodP50608 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
FmodP50608 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FmodP50608 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FmodP50608 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FmodP50608 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FmodP50608 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FmodP50608 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
FmodP50608 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FmodP50608 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FmodP50608 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FmodP50608 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FmodP50608 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
FmodP50608 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FmodP50608 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FmodP50608 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FmodP50608 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FmodP50608 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FmodP50608 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FmodP50608 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FmodP50608 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FmodP50608 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FmodP50608 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FmodP50608 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FmodP50608 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FmodP50608 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FmodP50608 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FmodP50608 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FmodP50608 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
FmodP50608 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FmodP50608 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FmodP50608 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FmodP50608 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FmodP50608 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
FmodP50608 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FmodP50608 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FmodP50608 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FmodP50608 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FmodP50608 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FmodP50608 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
FmodP50608 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FmodP50608 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FmodP50608 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FmodP50608 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FmodP50608 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FmodP50608 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FmodP50608 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FmodP50608 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FmodP50608 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FmodP50608 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FmodP50608 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FmodP50608 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FmodP50608 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FmodP50608 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FmodP50608 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FmodP50608 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
FmodP50608 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FmodP50608 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FmodP50608 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FmodP50608 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms