Protein–RNA interactions for Protein: P50404

Sftpd, Pulmonary surfactant-associated protein D, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpdP50404 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SftpdP50404 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SftpdP50404 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SftpdP50404 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SftpdP50404 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SftpdP50404 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SftpdP50404 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SftpdP50404 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SftpdP50404 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SftpdP50404 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SftpdP50404 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SftpdP50404 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SftpdP50404 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SftpdP50404 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SftpdP50404 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SftpdP50404 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SftpdP50404 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SftpdP50404 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SftpdP50404 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SftpdP50404 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SftpdP50404 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SftpdP50404 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SftpdP50404 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SftpdP50404 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SftpdP50404 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SftpdP50404 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SftpdP50404 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SftpdP50404 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SftpdP50404 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SftpdP50404 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SftpdP50404 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SftpdP50404 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SftpdP50404 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SftpdP50404 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SftpdP50404 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SftpdP50404 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SftpdP50404 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SftpdP50404 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SftpdP50404 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SftpdP50404 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SftpdP50404 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SftpdP50404 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SftpdP50404 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SftpdP50404 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SftpdP50404 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SftpdP50404 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SftpdP50404 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SftpdP50404 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SftpdP50404 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SftpdP50404 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SftpdP50404 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SftpdP50404 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SftpdP50404 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SftpdP50404 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SftpdP50404 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SftpdP50404 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SftpdP50404 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SftpdP50404 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SftpdP50404 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SftpdP50404 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SftpdP50404 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SftpdP50404 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SftpdP50404 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SftpdP50404 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SftpdP50404 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SftpdP50404 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SftpdP50404 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SftpdP50404 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SftpdP50404 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SftpdP50404 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SftpdP50404 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SftpdP50404 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SftpdP50404 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SftpdP50404 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SftpdP50404 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SftpdP50404 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SftpdP50404 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SftpdP50404 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SftpdP50404 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SftpdP50404 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SftpdP50404 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SftpdP50404 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SftpdP50404 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SftpdP50404 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SftpdP50404 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SftpdP50404 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SftpdP50404 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SftpdP50404 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SftpdP50404 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SftpdP50404 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SftpdP50404 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SftpdP50404 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SftpdP50404 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SftpdP50404 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SftpdP50404 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SftpdP50404 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SftpdP50404 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SftpdP50404 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SftpdP50404 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SftpdP50404 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms