Protein–RNA interactions for Protein: P48316

Gadd45a, Growth arrest and DNA damage-inducible protein GADD45 alpha, mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gadd45aP48316 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gadd45aP48316 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gadd45aP48316 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gadd45aP48316 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gadd45aP48316 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gadd45aP48316 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gadd45aP48316 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gadd45aP48316 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gadd45aP48316 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gadd45aP48316 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gadd45aP48316 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gadd45aP48316 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gadd45aP48316 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gadd45aP48316 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gadd45aP48316 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gadd45aP48316 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gadd45aP48316 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gadd45aP48316 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gadd45aP48316 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gadd45aP48316 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gadd45aP48316 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gadd45aP48316 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gadd45aP48316 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gadd45aP48316 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gadd45aP48316 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gadd45aP48316 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gadd45aP48316 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gadd45aP48316 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gadd45aP48316 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gadd45aP48316 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gadd45aP48316 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gadd45aP48316 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gadd45aP48316 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gadd45aP48316 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gadd45aP48316 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gadd45aP48316 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gadd45aP48316 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gadd45aP48316 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gadd45aP48316 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gadd45aP48316 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gadd45aP48316 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gadd45aP48316 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gadd45aP48316 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gadd45aP48316 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gadd45aP48316 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gadd45aP48316 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gadd45aP48316 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gadd45aP48316 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gadd45aP48316 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gadd45aP48316 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gadd45aP48316 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gadd45aP48316 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gadd45aP48316 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gadd45aP48316 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gadd45aP48316 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gadd45aP48316 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gadd45aP48316 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gadd45aP48316 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gadd45aP48316 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gadd45aP48316 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gadd45aP48316 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gadd45aP48316 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gadd45aP48316 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gadd45aP48316 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gadd45aP48316 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gadd45aP48316 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gadd45aP48316 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gadd45aP48316 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gadd45aP48316 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gadd45aP48316 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gadd45aP48316 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gadd45aP48316 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gadd45aP48316 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gadd45aP48316 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gadd45aP48316 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gadd45aP48316 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gadd45aP48316 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gadd45aP48316 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gadd45aP48316 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gadd45aP48316 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gadd45aP48316 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gadd45aP48316 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gadd45aP48316 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gadd45aP48316 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gadd45aP48316 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gadd45aP48316 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gadd45aP48316 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gadd45aP48316 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gadd45aP48316 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gadd45aP48316 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gadd45aP48316 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gadd45aP48316 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gadd45aP48316 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gadd45aP48316 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gadd45aP48316 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gadd45aP48316 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gadd45aP48316 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gadd45aP48316 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gadd45aP48316 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gadd45aP48316 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms