Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SrprbP47758 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SrprbP47758 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SrprbP47758 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SrprbP47758 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SrprbP47758 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SrprbP47758 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SrprbP47758 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SrprbP47758 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SrprbP47758 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SrprbP47758 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SrprbP47758 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SrprbP47758 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SrprbP47758 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SrprbP47758 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SrprbP47758 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SrprbP47758 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SrprbP47758 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
SrprbP47758 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SrprbP47758 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SrprbP47758 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SrprbP47758 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SrprbP47758 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SrprbP47758 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SrprbP47758 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SrprbP47758 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SrprbP47758 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SrprbP47758 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SrprbP47758 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SrprbP47758 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SrprbP47758 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SrprbP47758 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SrprbP47758 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SrprbP47758 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SrprbP47758 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SrprbP47758 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SrprbP47758 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SrprbP47758 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SrprbP47758 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SrprbP47758 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SrprbP47758 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SrprbP47758 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SrprbP47758 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SrprbP47758 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SrprbP47758 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SrprbP47758 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SrprbP47758 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SrprbP47758 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SrprbP47758 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SrprbP47758 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SrprbP47758 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SrprbP47758 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SrprbP47758 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SrprbP47758 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SrprbP47758 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SrprbP47758 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SrprbP47758 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SrprbP47758 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SrprbP47758 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SrprbP47758 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SrprbP47758 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SrprbP47758 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SrprbP47758 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SrprbP47758 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SrprbP47758 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SrprbP47758 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SrprbP47758 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SrprbP47758 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SrprbP47758 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SrprbP47758 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SrprbP47758 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SrprbP47758 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SrprbP47758 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SrprbP47758 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SrprbP47758 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SrprbP47758 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SrprbP47758 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SrprbP47758 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SrprbP47758 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SrprbP47758 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SrprbP47758 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SrprbP47758 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SrprbP47758 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SrprbP47758 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SrprbP47758 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SrprbP47758 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SrprbP47758 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SrprbP47758 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SrprbP47758 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SrprbP47758 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SrprbP47758 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SrprbP47758 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SrprbP47758 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SrprbP47758 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SrprbP47758 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SrprbP47758 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SrprbP47758 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SrprbP47758 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SrprbP47758 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SrprbP47758 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms