Protein–RNA interactions for Protein: P47239

Pax7, Paired box protein Pax-7, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax7P47239 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pax7P47239 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pax7P47239 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pax7P47239 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pax7P47239 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pax7P47239 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pax7P47239 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pax7P47239 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pax7P47239 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pax7P47239 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pax7P47239 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pax7P47239 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pax7P47239 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pax7P47239 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pax7P47239 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pax7P47239 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pax7P47239 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pax7P47239 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pax7P47239 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pax7P47239 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pax7P47239 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pax7P47239 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pax7P47239 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pax7P47239 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pax7P47239 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pax7P47239 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pax7P47239 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pax7P47239 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pax7P47239 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pax7P47239 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pax7P47239 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pax7P47239 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pax7P47239 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pax7P47239 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pax7P47239 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pax7P47239 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pax7P47239 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pax7P47239 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pax7P47239 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pax7P47239 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pax7P47239 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pax7P47239 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pax7P47239 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pax7P47239 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pax7P47239 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pax7P47239 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pax7P47239 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pax7P47239 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pax7P47239 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pax7P47239 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pax7P47239 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pax7P47239 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pax7P47239 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pax7P47239 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pax7P47239 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pax7P47239 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pax7P47239 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pax7P47239 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pax7P47239 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pax7P47239 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pax7P47239 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pax7P47239 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pax7P47239 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pax7P47239 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pax7P47239 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pax7P47239 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pax7P47239 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pax7P47239 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pax7P47239 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pax7P47239 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pax7P47239 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pax7P47239 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pax7P47239 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pax7P47239 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pax7P47239 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pax7P47239 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pax7P47239 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pax7P47239 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pax7P47239 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pax7P47239 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pax7P47239 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pax7P47239 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pax7P47239 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pax7P47239 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pax7P47239 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pax7P47239 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pax7P47239 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pax7P47239 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pax7P47239 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pax7P47239 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pax7P47239 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pax7P47239 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pax7P47239 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pax7P47239 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pax7P47239 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pax7P47239 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pax7P47239 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pax7P47239 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pax7P47239 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pax7P47239 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms