Protein–RNA interactions for Protein: P43488

Tnfsf4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf4P43488 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfsf4P43488 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfsf4P43488 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfsf4P43488 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfsf4P43488 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfsf4P43488 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfsf4P43488 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfsf4P43488 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfsf4P43488 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfsf4P43488 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfsf4P43488 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfsf4P43488 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfsf4P43488 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfsf4P43488 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfsf4P43488 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfsf4P43488 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfsf4P43488 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfsf4P43488 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfsf4P43488 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfsf4P43488 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfsf4P43488 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfsf4P43488 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfsf4P43488 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfsf4P43488 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfsf4P43488 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfsf4P43488 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfsf4P43488 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfsf4P43488 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfsf4P43488 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfsf4P43488 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfsf4P43488 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfsf4P43488 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfsf4P43488 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfsf4P43488 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfsf4P43488 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfsf4P43488 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfsf4P43488 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfsf4P43488 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfsf4P43488 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfsf4P43488 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfsf4P43488 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfsf4P43488 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfsf4P43488 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfsf4P43488 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfsf4P43488 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfsf4P43488 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfsf4P43488 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfsf4P43488 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfsf4P43488 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfsf4P43488 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfsf4P43488 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfsf4P43488 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfsf4P43488 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfsf4P43488 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfsf4P43488 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfsf4P43488 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfsf4P43488 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfsf4P43488 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfsf4P43488 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfsf4P43488 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfsf4P43488 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfsf4P43488 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfsf4P43488 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfsf4P43488 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfsf4P43488 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfsf4P43488 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfsf4P43488 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfsf4P43488 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfsf4P43488 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfsf4P43488 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfsf4P43488 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfsf4P43488 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfsf4P43488 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfsf4P43488 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfsf4P43488 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfsf4P43488 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfsf4P43488 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfsf4P43488 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfsf4P43488 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfsf4P43488 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfsf4P43488 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfsf4P43488 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfsf4P43488 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfsf4P43488 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfsf4P43488 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfsf4P43488 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfsf4P43488 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfsf4P43488 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfsf4P43488 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfsf4P43488 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfsf4P43488 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfsf4P43488 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfsf4P43488 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfsf4P43488 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfsf4P43488 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfsf4P43488 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfsf4P43488 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfsf4P43488 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfsf4P43488 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfsf4P43488 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms