Protein–RNA interactions for Protein: P43021

Nodal, Nodal, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NodalP43021 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NodalP43021 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NodalP43021 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NodalP43021 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NodalP43021 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NodalP43021 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NodalP43021 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NodalP43021 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NodalP43021 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NodalP43021 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NodalP43021 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NodalP43021 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NodalP43021 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NodalP43021 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NodalP43021 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NodalP43021 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NodalP43021 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NodalP43021 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NodalP43021 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NodalP43021 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NodalP43021 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NodalP43021 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NodalP43021 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NodalP43021 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NodalP43021 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NodalP43021 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NodalP43021 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NodalP43021 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NodalP43021 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NodalP43021 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NodalP43021 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NodalP43021 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NodalP43021 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NodalP43021 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NodalP43021 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NodalP43021 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NodalP43021 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NodalP43021 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NodalP43021 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NodalP43021 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NodalP43021 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NodalP43021 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NodalP43021 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NodalP43021 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NodalP43021 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NodalP43021 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NodalP43021 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NodalP43021 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NodalP43021 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NodalP43021 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NodalP43021 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NodalP43021 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NodalP43021 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NodalP43021 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NodalP43021 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NodalP43021 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NodalP43021 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NodalP43021 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NodalP43021 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NodalP43021 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NodalP43021 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NodalP43021 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NodalP43021 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NodalP43021 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NodalP43021 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
NodalP43021 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
NodalP43021 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NodalP43021 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
NodalP43021 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
NodalP43021 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NodalP43021 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NodalP43021 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NodalP43021 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NodalP43021 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NodalP43021 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NodalP43021 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NodalP43021 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NodalP43021 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NodalP43021 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NodalP43021 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NodalP43021 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NodalP43021 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NodalP43021 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NodalP43021 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NodalP43021 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NodalP43021 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NodalP43021 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NodalP43021 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NodalP43021 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NodalP43021 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NodalP43021 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NodalP43021 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NodalP43021 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NodalP43021 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NodalP43021 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NodalP43021 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NodalP43021 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NodalP43021 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NodalP43021 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NodalP43021 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms