Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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