Protein–RNA interactions for Protein: P40226

Thpo, Thrombopoietin, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ThpoP40226 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
ThpoP40226 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ThpoP40226 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ThpoP40226 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ThpoP40226 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ThpoP40226 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ThpoP40226 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
ThpoP40226 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
ThpoP40226 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ThpoP40226 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ThpoP40226 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
ThpoP40226 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ThpoP40226 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ThpoP40226 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ThpoP40226 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ThpoP40226 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ThpoP40226 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ThpoP40226 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ThpoP40226 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ThpoP40226 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ThpoP40226 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ThpoP40226 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ThpoP40226 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ThpoP40226 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ThpoP40226 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ThpoP40226 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ThpoP40226 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ThpoP40226 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ThpoP40226 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ThpoP40226 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ThpoP40226 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ThpoP40226 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ThpoP40226 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ThpoP40226 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ThpoP40226 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ThpoP40226 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ThpoP40226 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ThpoP40226 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
ThpoP40226 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ThpoP40226 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ThpoP40226 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ThpoP40226 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ThpoP40226 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ThpoP40226 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ThpoP40226 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ThpoP40226 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ThpoP40226 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ThpoP40226 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ThpoP40226 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ThpoP40226 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ThpoP40226 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ThpoP40226 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ThpoP40226 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ThpoP40226 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ThpoP40226 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ThpoP40226 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ThpoP40226 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ThpoP40226 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ThpoP40226 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ThpoP40226 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ThpoP40226 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ThpoP40226 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ThpoP40226 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ThpoP40226 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ThpoP40226 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ThpoP40226 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ThpoP40226 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ThpoP40226 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ThpoP40226 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ThpoP40226 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ThpoP40226 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ThpoP40226 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ThpoP40226 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ThpoP40226 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ThpoP40226 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ThpoP40226 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ThpoP40226 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ThpoP40226 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ThpoP40226 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ThpoP40226 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ThpoP40226 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ThpoP40226 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ThpoP40226 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ThpoP40226 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ThpoP40226 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ThpoP40226 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ThpoP40226 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ThpoP40226 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ThpoP40226 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ThpoP40226 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ThpoP40226 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ThpoP40226 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ThpoP40226 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ThpoP40226 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ThpoP40226 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ThpoP40226 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ThpoP40226 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ThpoP40226 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ThpoP40226 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ThpoP40226 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms