Protein–RNA interactions for Protein: P35396

Ppard, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpardP35396 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PpardP35396 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PpardP35396 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PpardP35396 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PpardP35396 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PpardP35396 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PpardP35396 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PpardP35396 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PpardP35396 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PpardP35396 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PpardP35396 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PpardP35396 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PpardP35396 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PpardP35396 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PpardP35396 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PpardP35396 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PpardP35396 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PpardP35396 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PpardP35396 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PpardP35396 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PpardP35396 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PpardP35396 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PpardP35396 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PpardP35396 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PpardP35396 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PpardP35396 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PpardP35396 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PpardP35396 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PpardP35396 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PpardP35396 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PpardP35396 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PpardP35396 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PpardP35396 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PpardP35396 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PpardP35396 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PpardP35396 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PpardP35396 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PpardP35396 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PpardP35396 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PpardP35396 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PpardP35396 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PpardP35396 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PpardP35396 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PpardP35396 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PpardP35396 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PpardP35396 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PpardP35396 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PpardP35396 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PpardP35396 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PpardP35396 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PpardP35396 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PpardP35396 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PpardP35396 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PpardP35396 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PpardP35396 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PpardP35396 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PpardP35396 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PpardP35396 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PpardP35396 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PpardP35396 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PpardP35396 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PpardP35396 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PpardP35396 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PpardP35396 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PpardP35396 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PpardP35396 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PpardP35396 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PpardP35396 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PpardP35396 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PpardP35396 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PpardP35396 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PpardP35396 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PpardP35396 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PpardP35396 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PpardP35396 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PpardP35396 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PpardP35396 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PpardP35396 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PpardP35396 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PpardP35396 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PpardP35396 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PpardP35396 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PpardP35396 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PpardP35396 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PpardP35396 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PpardP35396 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PpardP35396 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PpardP35396 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PpardP35396 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PpardP35396 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PpardP35396 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PpardP35396 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PpardP35396 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PpardP35396 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PpardP35396 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PpardP35396 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PpardP35396 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PpardP35396 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PpardP35396 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PpardP35396 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms