Protein–RNA interactions for Protein: P34152

Ptk2, Focal adhesion kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptk2P34152 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ptk2P34152 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ptk2P34152 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ptk2P34152 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ptk2P34152 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ptk2P34152 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ptk2P34152 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ptk2P34152 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ptk2P34152 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ptk2P34152 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ptk2P34152 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ptk2P34152 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ptk2P34152 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ptk2P34152 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ptk2P34152 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ptk2P34152 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ptk2P34152 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ptk2P34152 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ptk2P34152 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ptk2P34152 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ptk2P34152 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ptk2P34152 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ptk2P34152 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ptk2P34152 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ptk2P34152 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ptk2P34152 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ptk2P34152 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ptk2P34152 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ptk2P34152 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ptk2P34152 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ptk2P34152 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ptk2P34152 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ptk2P34152 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ptk2P34152 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ptk2P34152 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ptk2P34152 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ptk2P34152 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ptk2P34152 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ptk2P34152 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ptk2P34152 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ptk2P34152 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ptk2P34152 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ptk2P34152 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ptk2P34152 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ptk2P34152 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ptk2P34152 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ptk2P34152 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ptk2P34152 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ptk2P34152 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ptk2P34152 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ptk2P34152 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ptk2P34152 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ptk2P34152 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ptk2P34152 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ptk2P34152 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ptk2P34152 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ptk2P34152 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ptk2P34152 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ptk2P34152 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ptk2P34152 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ptk2P34152 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ptk2P34152 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ptk2P34152 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ptk2P34152 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ptk2P34152 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ptk2P34152 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ptk2P34152 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ptk2P34152 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ptk2P34152 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ptk2P34152 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ptk2P34152 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ptk2P34152 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ptk2P34152 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ptk2P34152 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ptk2P34152 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ptk2P34152 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ptk2P34152 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ptk2P34152 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ptk2P34152 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ptk2P34152 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ptk2P34152 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ptk2P34152 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ptk2P34152 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ptk2P34152 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ptk2P34152 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ptk2P34152 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ptk2P34152 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ptk2P34152 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ptk2P34152 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ptk2P34152 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ptk2P34152 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ptk2P34152 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ptk2P34152 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ptk2P34152 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ptk2P34152 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ptk2P34152 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ptk2P34152 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ptk2P34152 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ptk2P34152 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Ptk2P34152 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms