Protein–RNA interactions for Protein: P33146

Cdh15, Cadherin-15, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh15P33146 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdh15P33146 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdh15P33146 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdh15P33146 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdh15P33146 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdh15P33146 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdh15P33146 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdh15P33146 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdh15P33146 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdh15P33146 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdh15P33146 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdh15P33146 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdh15P33146 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdh15P33146 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdh15P33146 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdh15P33146 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdh15P33146 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdh15P33146 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdh15P33146 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdh15P33146 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdh15P33146 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdh15P33146 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdh15P33146 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdh15P33146 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdh15P33146 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cdh15P33146 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cdh15P33146 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cdh15P33146 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdh15P33146 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdh15P33146 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdh15P33146 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdh15P33146 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdh15P33146 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdh15P33146 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdh15P33146 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdh15P33146 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdh15P33146 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdh15P33146 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdh15P33146 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdh15P33146 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdh15P33146 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdh15P33146 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdh15P33146 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdh15P33146 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdh15P33146 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdh15P33146 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdh15P33146 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdh15P33146 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdh15P33146 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdh15P33146 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdh15P33146 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdh15P33146 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdh15P33146 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdh15P33146 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdh15P33146 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdh15P33146 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdh15P33146 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdh15P33146 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdh15P33146 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdh15P33146 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdh15P33146 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdh15P33146 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdh15P33146 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdh15P33146 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdh15P33146 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdh15P33146 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdh15P33146 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdh15P33146 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdh15P33146 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdh15P33146 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdh15P33146 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdh15P33146 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdh15P33146 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdh15P33146 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdh15P33146 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdh15P33146 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdh15P33146 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdh15P33146 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdh15P33146 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdh15P33146 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdh15P33146 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdh15P33146 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdh15P33146 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdh15P33146 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdh15P33146 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdh15P33146 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdh15P33146 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdh15P33146 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdh15P33146 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdh15P33146 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdh15P33146 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdh15P33146 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdh15P33146 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdh15P33146 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdh15P33146 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdh15P33146 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdh15P33146 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdh15P33146 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdh15P33146 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdh15P33146 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms