Protein–RNA interactions for Protein: P30548

Tacr1, Substance-P receptor, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tacr1P30548 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tacr1P30548 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tacr1P30548 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tacr1P30548 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tacr1P30548 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tacr1P30548 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tacr1P30548 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tacr1P30548 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tacr1P30548 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tacr1P30548 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tacr1P30548 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tacr1P30548 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tacr1P30548 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tacr1P30548 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tacr1P30548 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tacr1P30548 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tacr1P30548 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tacr1P30548 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tacr1P30548 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tacr1P30548 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tacr1P30548 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tacr1P30548 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tacr1P30548 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tacr1P30548 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tacr1P30548 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tacr1P30548 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tacr1P30548 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tacr1P30548 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tacr1P30548 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tacr1P30548 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tacr1P30548 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tacr1P30548 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tacr1P30548 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tacr1P30548 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tacr1P30548 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tacr1P30548 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tacr1P30548 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tacr1P30548 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tacr1P30548 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tacr1P30548 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tacr1P30548 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tacr1P30548 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tacr1P30548 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tacr1P30548 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tacr1P30548 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tacr1P30548 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tacr1P30548 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tacr1P30548 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tacr1P30548 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tacr1P30548 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tacr1P30548 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tacr1P30548 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tacr1P30548 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tacr1P30548 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tacr1P30548 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tacr1P30548 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tacr1P30548 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tacr1P30548 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tacr1P30548 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tacr1P30548 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tacr1P30548 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tacr1P30548 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tacr1P30548 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tacr1P30548 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tacr1P30548 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tacr1P30548 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tacr1P30548 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tacr1P30548 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tacr1P30548 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tacr1P30548 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tacr1P30548 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tacr1P30548 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tacr1P30548 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tacr1P30548 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tacr1P30548 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tacr1P30548 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tacr1P30548 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tacr1P30548 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tacr1P30548 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tacr1P30548 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tacr1P30548 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tacr1P30548 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tacr1P30548 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tacr1P30548 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tacr1P30548 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tacr1P30548 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tacr1P30548 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tacr1P30548 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tacr1P30548 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tacr1P30548 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tacr1P30548 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tacr1P30548 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tacr1P30548 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tacr1P30548 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tacr1P30548 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tacr1P30548 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tacr1P30548 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tacr1P30548 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tacr1P30548 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tacr1P30548 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms