Protein–RNA interactions for Protein: P29595

Nedd8, NEDD8, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd8P29595 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nedd8P29595 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nedd8P29595 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nedd8P29595 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nedd8P29595 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nedd8P29595 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nedd8P29595 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nedd8P29595 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nedd8P29595 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nedd8P29595 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nedd8P29595 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nedd8P29595 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nedd8P29595 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nedd8P29595 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nedd8P29595 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nedd8P29595 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nedd8P29595 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nedd8P29595 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nedd8P29595 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nedd8P29595 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nedd8P29595 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nedd8P29595 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nedd8P29595 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nedd8P29595 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nedd8P29595 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nedd8P29595 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nedd8P29595 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nedd8P29595 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nedd8P29595 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nedd8P29595 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nedd8P29595 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nedd8P29595 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nedd8P29595 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nedd8P29595 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nedd8P29595 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nedd8P29595 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nedd8P29595 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nedd8P29595 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nedd8P29595 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nedd8P29595 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nedd8P29595 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nedd8P29595 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nedd8P29595 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nedd8P29595 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nedd8P29595 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nedd8P29595 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nedd8P29595 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nedd8P29595 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nedd8P29595 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nedd8P29595 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nedd8P29595 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nedd8P29595 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nedd8P29595 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nedd8P29595 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nedd8P29595 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nedd8P29595 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nedd8P29595 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nedd8P29595 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nedd8P29595 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nedd8P29595 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nedd8P29595 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nedd8P29595 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nedd8P29595 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Nedd8P29595 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nedd8P29595 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nedd8P29595 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nedd8P29595 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nedd8P29595 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nedd8P29595 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nedd8P29595 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nedd8P29595 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nedd8P29595 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nedd8P29595 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nedd8P29595 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nedd8P29595 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nedd8P29595 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nedd8P29595 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nedd8P29595 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nedd8P29595 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nedd8P29595 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nedd8P29595 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nedd8P29595 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nedd8P29595 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nedd8P29595 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Nedd8P29595 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nedd8P29595 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nedd8P29595 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nedd8P29595 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nedd8P29595 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nedd8P29595 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nedd8P29595 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nedd8P29595 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nedd8P29595 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nedd8P29595 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nedd8P29595 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nedd8P29595 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nedd8P29595 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nedd8P29595 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nedd8P29595 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nedd8P29595 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms