Protein–RNA interactions for Protein: P28654

Dcn, Decorin, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DcnP28654 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DcnP28654 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DcnP28654 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DcnP28654 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
DcnP28654 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DcnP28654 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DcnP28654 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DcnP28654 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DcnP28654 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DcnP28654 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DcnP28654 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DcnP28654 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DcnP28654 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DcnP28654 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DcnP28654 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DcnP28654 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DcnP28654 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DcnP28654 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DcnP28654 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DcnP28654 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DcnP28654 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DcnP28654 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DcnP28654 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DcnP28654 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DcnP28654 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DcnP28654 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DcnP28654 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
DcnP28654 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DcnP28654 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DcnP28654 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
DcnP28654 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
DcnP28654 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
DcnP28654 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DcnP28654 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DcnP28654 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DcnP28654 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DcnP28654 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DcnP28654 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DcnP28654 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
DcnP28654 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DcnP28654 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DcnP28654 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DcnP28654 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DcnP28654 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DcnP28654 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DcnP28654 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DcnP28654 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DcnP28654 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DcnP28654 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DcnP28654 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DcnP28654 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DcnP28654 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DcnP28654 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DcnP28654 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DcnP28654 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DcnP28654 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
DcnP28654 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.05■□□□□ 0
DcnP28654 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
DcnP28654 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
DcnP28654 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
DcnP28654 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
DcnP28654 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
DcnP28654 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
DcnP28654 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
DcnP28654 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
DcnP28654 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DcnP28654 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.05■□□□□ -0
DcnP28654 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
DcnP28654 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
DcnP28654 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DcnP28654 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DcnP28654 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DcnP28654 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DcnP28654 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DcnP28654 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DcnP28654 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
DcnP28654 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
DcnP28654 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
DcnP28654 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DcnP28654 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DcnP28654 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DcnP28654 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DcnP28654 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
DcnP28654 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DcnP28654 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DcnP28654 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
DcnP28654 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.04■□□□□ -0
DcnP28654 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DcnP28654 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DcnP28654 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DcnP28654 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.04■□□□□ -0
DcnP28654 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.04■□□□□ -0
DcnP28654 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
DcnP28654 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DcnP28654 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DcnP28654 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
DcnP28654 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
DcnP28654 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
DcnP28654 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DcnP28654 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms