Protein–RNA interactions for Protein: P28310

Defa3, Alpha-defensin 3, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa3P28310 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Defa3P28310 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Defa3P28310 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Defa3P28310 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Defa3P28310 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Defa3P28310 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Defa3P28310 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Defa3P28310 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Defa3P28310 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Defa3P28310 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Defa3P28310 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Defa3P28310 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Defa3P28310 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Defa3P28310 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Defa3P28310 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Defa3P28310 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Defa3P28310 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Defa3P28310 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Defa3P28310 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Defa3P28310 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Defa3P28310 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Defa3P28310 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Defa3P28310 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Defa3P28310 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Defa3P28310 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Defa3P28310 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Defa3P28310 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Defa3P28310 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Defa3P28310 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Defa3P28310 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Defa3P28310 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Defa3P28310 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Defa3P28310 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Defa3P28310 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Defa3P28310 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Defa3P28310 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Defa3P28310 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Defa3P28310 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Defa3P28310 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Defa3P28310 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Defa3P28310 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Defa3P28310 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Defa3P28310 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Defa3P28310 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Defa3P28310 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Defa3P28310 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Defa3P28310 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Defa3P28310 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Defa3P28310 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Defa3P28310 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Defa3P28310 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Defa3P28310 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Defa3P28310 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Defa3P28310 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Defa3P28310 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Defa3P28310 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Defa3P28310 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Defa3P28310 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Defa3P28310 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Defa3P28310 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Defa3P28310 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Defa3P28310 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Defa3P28310 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Defa3P28310 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Defa3P28310 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Defa3P28310 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Defa3P28310 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Defa3P28310 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Defa3P28310 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Defa3P28310 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Defa3P28310 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Defa3P28310 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Defa3P28310 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Defa3P28310 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Defa3P28310 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Defa3P28310 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Defa3P28310 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Defa3P28310 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Defa3P28310 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Defa3P28310 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Defa3P28310 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Defa3P28310 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Defa3P28310 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Defa3P28310 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Defa3P28310 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Defa3P28310 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Defa3P28310 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Defa3P28310 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Defa3P28310 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Defa3P28310 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Defa3P28310 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Defa3P28310 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Defa3P28310 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Defa3P28310 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Defa3P28310 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Defa3P28310 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC11.83□□□□□ -0.51
Defa3P28310 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Defa3P28310 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Defa3P28310 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Defa3P28310 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms