Protein–RNA interactions for Protein: P28231

Gjb3, Gap junction beta-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb3P28231 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gjb3P28231 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gjb3P28231 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gjb3P28231 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gjb3P28231 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gjb3P28231 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Gjb3P28231 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gjb3P28231 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gjb3P28231 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gjb3P28231 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gjb3P28231 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gjb3P28231 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gjb3P28231 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gjb3P28231 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gjb3P28231 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gjb3P28231 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gjb3P28231 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gjb3P28231 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gjb3P28231 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gjb3P28231 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gjb3P28231 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gjb3P28231 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gjb3P28231 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gjb3P28231 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gjb3P28231 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gjb3P28231 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gjb3P28231 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gjb3P28231 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gjb3P28231 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Gjb3P28231 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gjb3P28231 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gjb3P28231 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gjb3P28231 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gjb3P28231 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Gjb3P28231 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gjb3P28231 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Gjb3P28231 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gjb3P28231 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gjb3P28231 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gjb3P28231 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gjb3P28231 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gjb3P28231 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gjb3P28231 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gjb3P28231 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gjb3P28231 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gjb3P28231 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gjb3P28231 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gjb3P28231 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gjb3P28231 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gjb3P28231 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gjb3P28231 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gjb3P28231 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gjb3P28231 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Gjb3P28231 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gjb3P28231 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gjb3P28231 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gjb3P28231 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gjb3P28231 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Gjb3P28231 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gjb3P28231 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gjb3P28231 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gjb3P28231 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gjb3P28231 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gjb3P28231 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gjb3P28231 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gjb3P28231 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gjb3P28231 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gjb3P28231 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gjb3P28231 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gjb3P28231 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Gjb3P28231 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gjb3P28231 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gjb3P28231 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gjb3P28231 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gjb3P28231 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gjb3P28231 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gjb3P28231 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gjb3P28231 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gjb3P28231 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gjb3P28231 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gjb3P28231 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gjb3P28231 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gjb3P28231 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gjb3P28231 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gjb3P28231 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gjb3P28231 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gjb3P28231 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gjb3P28231 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gjb3P28231 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gjb3P28231 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gjb3P28231 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gjb3P28231 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gjb3P28231 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gjb3P28231 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gjb3P28231 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gjb3P28231 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gjb3P28231 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gjb3P28231 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gjb3P28231 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Gjb3P28231 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms