Protein–RNA interactions for Protein: P23607

Zfa, Zinc finger autosomal protein, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZfaP23607 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZfaP23607 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZfaP23607 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZfaP23607 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZfaP23607 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZfaP23607 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZfaP23607 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZfaP23607 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZfaP23607 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZfaP23607 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZfaP23607 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZfaP23607 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZfaP23607 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZfaP23607 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZfaP23607 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZfaP23607 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZfaP23607 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZfaP23607 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZfaP23607 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZfaP23607 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZfaP23607 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZfaP23607 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZfaP23607 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZfaP23607 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZfaP23607 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZfaP23607 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZfaP23607 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZfaP23607 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZfaP23607 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZfaP23607 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZfaP23607 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ZfaP23607 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZfaP23607 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZfaP23607 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZfaP23607 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZfaP23607 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZfaP23607 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZfaP23607 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZfaP23607 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZfaP23607 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZfaP23607 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZfaP23607 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZfaP23607 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZfaP23607 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZfaP23607 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZfaP23607 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ZfaP23607 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZfaP23607 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZfaP23607 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZfaP23607 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ZfaP23607 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZfaP23607 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZfaP23607 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZfaP23607 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZfaP23607 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ZfaP23607 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZfaP23607 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZfaP23607 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZfaP23607 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZfaP23607 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZfaP23607 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZfaP23607 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZfaP23607 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZfaP23607 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZfaP23607 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZfaP23607 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZfaP23607 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZfaP23607 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZfaP23607 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZfaP23607 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZfaP23607 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZfaP23607 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZfaP23607 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZfaP23607 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZfaP23607 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZfaP23607 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZfaP23607 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZfaP23607 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ZfaP23607 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZfaP23607 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ZfaP23607 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ZfaP23607 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZfaP23607 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZfaP23607 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZfaP23607 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZfaP23607 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZfaP23607 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZfaP23607 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZfaP23607 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ZfaP23607 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZfaP23607 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZfaP23607 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZfaP23607 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZfaP23607 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZfaP23607 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZfaP23607 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ZfaP23607 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZfaP23607 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ZfaP23607 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
ZfaP23607 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms