Protein–RNA interactions for Protein: P19253

Rpl13a, 60S ribosomal protein L13a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13aP19253 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rpl13aP19253 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rpl13aP19253 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rpl13aP19253 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rpl13aP19253 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rpl13aP19253 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rpl13aP19253 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rpl13aP19253 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rpl13aP19253 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rpl13aP19253 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rpl13aP19253 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rpl13aP19253 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rpl13aP19253 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rpl13aP19253 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rpl13aP19253 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rpl13aP19253 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rpl13aP19253 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rpl13aP19253 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rpl13aP19253 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rpl13aP19253 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rpl13aP19253 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rpl13aP19253 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Rpl13aP19253 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Rpl13aP19253 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Rpl13aP19253 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rpl13aP19253 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rpl13aP19253 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rpl13aP19253 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rpl13aP19253 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rpl13aP19253 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rpl13aP19253 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rpl13aP19253 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rpl13aP19253 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rpl13aP19253 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rpl13aP19253 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rpl13aP19253 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rpl13aP19253 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rpl13aP19253 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Rpl13aP19253 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Rpl13aP19253 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Rpl13aP19253 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rpl13aP19253 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rpl13aP19253 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Rpl13aP19253 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rpl13aP19253 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rpl13aP19253 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rpl13aP19253 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rpl13aP19253 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rpl13aP19253 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rpl13aP19253 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rpl13aP19253 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rpl13aP19253 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rpl13aP19253 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rpl13aP19253 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rpl13aP19253 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rpl13aP19253 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rpl13aP19253 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rpl13aP19253 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rpl13aP19253 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rpl13aP19253 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rpl13aP19253 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rpl13aP19253 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Rpl13aP19253 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rpl13aP19253 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rpl13aP19253 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rpl13aP19253 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rpl13aP19253 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rpl13aP19253 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rpl13aP19253 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Rpl13aP19253 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rpl13aP19253 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Rpl13aP19253 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rpl13aP19253 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Rpl13aP19253 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rpl13aP19253 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rpl13aP19253 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rpl13aP19253 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rpl13aP19253 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rpl13aP19253 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rpl13aP19253 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rpl13aP19253 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rpl13aP19253 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rpl13aP19253 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rpl13aP19253 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rpl13aP19253 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rpl13aP19253 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rpl13aP19253 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rpl13aP19253 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rpl13aP19253 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rpl13aP19253 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rpl13aP19253 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rpl13aP19253 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rpl13aP19253 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rpl13aP19253 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rpl13aP19253 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rpl13aP19253 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rpl13aP19253 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rpl13aP19253 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rpl13aP19253 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rpl13aP19253 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms