Protein–RNA interactions for Protein: P18524

Ig heavy chain V region RF, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18524 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P18524 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P18524 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
P18524 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P18524 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
P18524 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P18524 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P18524 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P18524 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P18524 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P18524 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
P18524 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
P18524 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
P18524 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P18524 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P18524 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P18524 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
P18524 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
P18524 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P18524 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P18524 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P18524 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P18524 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P18524 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
P18524 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P18524 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P18524 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P18524 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P18524 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
P18524 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P18524 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
P18524 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
P18524 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
P18524 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P18524 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
P18524 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
P18524 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
P18524 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
P18524 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P18524 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P18524 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
P18524 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P18524 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P18524 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
P18524 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
P18524 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P18524 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P18524 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
P18524 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P18524 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
P18524 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
P18524 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
P18524 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
P18524 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
P18524 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
P18524 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
P18524 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P18524 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P18524 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P18524 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P18524 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
P18524 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
P18524 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P18524 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P18524 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P18524 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
P18524 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P18524 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P18524 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
P18524 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
P18524 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P18524 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P18524 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P18524 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P18524 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
P18524 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P18524 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P18524 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P18524 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P18524 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P18524 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
P18524 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
P18524 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P18524 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P18524 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P18524 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
P18524 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
P18524 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
P18524 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
P18524 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P18524 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
P18524 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
P18524 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
P18524 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P18524 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P18524 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P18524 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P18524 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
P18524 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
P18524 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms