Protein–RNA interactions for Protein: P15375

Myf6, Myogenic factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myf6P15375 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Myf6P15375 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Myf6P15375 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Myf6P15375 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Myf6P15375 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Myf6P15375 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Myf6P15375 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Myf6P15375 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Myf6P15375 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Myf6P15375 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Myf6P15375 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Myf6P15375 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Myf6P15375 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Myf6P15375 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Myf6P15375 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Myf6P15375 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Myf6P15375 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Myf6P15375 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Myf6P15375 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Myf6P15375 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Myf6P15375 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Myf6P15375 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Myf6P15375 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Myf6P15375 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Myf6P15375 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Myf6P15375 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Myf6P15375 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Myf6P15375 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Myf6P15375 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Myf6P15375 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Myf6P15375 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Myf6P15375 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Myf6P15375 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Myf6P15375 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Myf6P15375 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Myf6P15375 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Myf6P15375 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Myf6P15375 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Myf6P15375 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Myf6P15375 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Myf6P15375 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Myf6P15375 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Myf6P15375 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Myf6P15375 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Myf6P15375 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Myf6P15375 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Myf6P15375 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Myf6P15375 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Myf6P15375 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Myf6P15375 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Myf6P15375 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Myf6P15375 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Myf6P15375 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Myf6P15375 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Myf6P15375 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Myf6P15375 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Myf6P15375 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Myf6P15375 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Myf6P15375 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Myf6P15375 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Myf6P15375 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Myf6P15375 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Myf6P15375 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Myf6P15375 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Myf6P15375 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Myf6P15375 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Myf6P15375 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Myf6P15375 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Myf6P15375 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Myf6P15375 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Myf6P15375 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Myf6P15375 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Myf6P15375 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Myf6P15375 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Myf6P15375 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Myf6P15375 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Myf6P15375 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Myf6P15375 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Myf6P15375 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Myf6P15375 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Myf6P15375 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Myf6P15375 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Myf6P15375 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Myf6P15375 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Myf6P15375 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Myf6P15375 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Myf6P15375 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Myf6P15375 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Myf6P15375 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Myf6P15375 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Myf6P15375 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Myf6P15375 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Myf6P15375 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Myf6P15375 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Myf6P15375 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Myf6P15375 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Myf6P15375 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Myf6P15375 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Myf6P15375 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Myf6P15375 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms