Protein–RNA interactions for Protein: P13516

Scd1, Acyl-CoA desaturase 1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scd1P13516 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scd1P13516 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scd1P13516 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scd1P13516 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scd1P13516 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scd1P13516 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scd1P13516 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scd1P13516 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scd1P13516 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scd1P13516 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scd1P13516 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scd1P13516 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scd1P13516 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scd1P13516 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scd1P13516 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scd1P13516 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scd1P13516 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scd1P13516 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scd1P13516 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scd1P13516 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scd1P13516 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scd1P13516 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scd1P13516 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scd1P13516 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scd1P13516 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scd1P13516 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scd1P13516 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scd1P13516 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scd1P13516 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scd1P13516 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scd1P13516 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scd1P13516 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scd1P13516 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scd1P13516 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scd1P13516 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scd1P13516 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scd1P13516 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scd1P13516 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scd1P13516 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scd1P13516 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scd1P13516 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scd1P13516 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scd1P13516 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scd1P13516 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scd1P13516 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scd1P13516 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Scd1P13516 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Scd1P13516 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Scd1P13516 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scd1P13516 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scd1P13516 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scd1P13516 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scd1P13516 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scd1P13516 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scd1P13516 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scd1P13516 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scd1P13516 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scd1P13516 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scd1P13516 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scd1P13516 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scd1P13516 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scd1P13516 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Scd1P13516 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scd1P13516 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scd1P13516 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scd1P13516 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scd1P13516 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scd1P13516 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scd1P13516 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scd1P13516 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scd1P13516 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scd1P13516 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scd1P13516 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scd1P13516 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scd1P13516 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scd1P13516 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scd1P13516 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scd1P13516 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scd1P13516 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scd1P13516 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scd1P13516 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scd1P13516 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scd1P13516 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scd1P13516 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scd1P13516 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scd1P13516 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Scd1P13516 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scd1P13516 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scd1P13516 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scd1P13516 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scd1P13516 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scd1P13516 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scd1P13516 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Scd1P13516 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Scd1P13516 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scd1P13516 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scd1P13516 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scd1P13516 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scd1P13516 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scd1P13516 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms