Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms