Protein–RNA interactions for Protein: P0DN90

Tmem254b, Transmembrane protein 254b, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem254bP0DN90 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmem254bP0DN90 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmem254bP0DN90 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmem254bP0DN90 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmem254bP0DN90 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmem254bP0DN90 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmem254bP0DN90 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmem254bP0DN90 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmem254bP0DN90 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmem254bP0DN90 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmem254bP0DN90 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmem254bP0DN90 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmem254bP0DN90 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmem254bP0DN90 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmem254bP0DN90 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmem254bP0DN90 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmem254bP0DN90 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmem254bP0DN90 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmem254bP0DN90 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmem254bP0DN90 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmem254bP0DN90 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmem254bP0DN90 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmem254bP0DN90 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmem254bP0DN90 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmem254bP0DN90 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmem254bP0DN90 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmem254bP0DN90 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmem254bP0DN90 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmem254bP0DN90 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmem254bP0DN90 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmem254bP0DN90 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmem254bP0DN90 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmem254bP0DN90 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmem254bP0DN90 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmem254bP0DN90 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmem254bP0DN90 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmem254bP0DN90 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmem254bP0DN90 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmem254bP0DN90 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmem254bP0DN90 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmem254bP0DN90 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmem254bP0DN90 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmem254bP0DN90 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmem254bP0DN90 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmem254bP0DN90 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmem254bP0DN90 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmem254bP0DN90 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmem254bP0DN90 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmem254bP0DN90 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem254bP0DN90 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem254bP0DN90 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem254bP0DN90 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem254bP0DN90 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem254bP0DN90 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem254bP0DN90 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem254bP0DN90 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem254bP0DN90 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem254bP0DN90 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem254bP0DN90 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem254bP0DN90 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem254bP0DN90 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem254bP0DN90 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem254bP0DN90 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem254bP0DN90 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem254bP0DN90 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem254bP0DN90 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem254bP0DN90 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem254bP0DN90 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem254bP0DN90 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem254bP0DN90 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem254bP0DN90 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem254bP0DN90 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem254bP0DN90 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem254bP0DN90 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem254bP0DN90 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem254bP0DN90 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem254bP0DN90 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem254bP0DN90 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem254bP0DN90 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem254bP0DN90 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem254bP0DN90 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem254bP0DN90 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem254bP0DN90 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem254bP0DN90 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem254bP0DN90 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem254bP0DN90 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem254bP0DN90 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem254bP0DN90 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem254bP0DN90 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem254bP0DN90 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem254bP0DN90 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem254bP0DN90 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem254bP0DN90 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem254bP0DN90 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem254bP0DN90 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem254bP0DN90 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem254bP0DN90 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem254bP0DN90 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem254bP0DN90 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem254bP0DN90 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms