Protein–RNA interactions for Protein: P06320

T-cell receptor beta chain V region CTL-F3, mousemouse

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06320 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P06320 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P06320 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P06320 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P06320 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P06320 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P06320 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P06320 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P06320 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P06320 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P06320 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P06320 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P06320 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P06320 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
P06320 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P06320 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P06320 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P06320 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P06320 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P06320 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P06320 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P06320 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P06320 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P06320 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P06320 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
P06320 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P06320 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
P06320 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P06320 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P06320 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
P06320 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P06320 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P06320 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P06320 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P06320 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P06320 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P06320 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
P06320 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
P06320 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
P06320 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P06320 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P06320 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P06320 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P06320 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P06320 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P06320 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P06320 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
P06320 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P06320 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P06320 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P06320 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P06320 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P06320 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P06320 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P06320 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P06320 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P06320 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P06320 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P06320 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P06320 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P06320 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P06320 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P06320 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P06320 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P06320 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P06320 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P06320 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P06320 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P06320 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P06320 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P06320 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P06320 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P06320 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P06320 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P06320 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P06320 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P06320 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P06320 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P06320 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P06320 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P06320 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P06320 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P06320 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P06320 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P06320 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P06320 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P06320 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P06320 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P06320 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P06320 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P06320 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P06320 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P06320 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
P06320 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P06320 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
P06320 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P06320 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P06320 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
P06320 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P06320 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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