Protein–RNA interactions for Protein: P05622

Pdgfrb, Platelet-derived growth factor receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrbP05622 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PdgfrbP05622 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PdgfrbP05622 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PdgfrbP05622 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PdgfrbP05622 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PdgfrbP05622 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PdgfrbP05622 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PdgfrbP05622 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PdgfrbP05622 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PdgfrbP05622 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PdgfrbP05622 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PdgfrbP05622 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PdgfrbP05622 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PdgfrbP05622 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PdgfrbP05622 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PdgfrbP05622 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PdgfrbP05622 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PdgfrbP05622 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PdgfrbP05622 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PdgfrbP05622 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PdgfrbP05622 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PdgfrbP05622 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PdgfrbP05622 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PdgfrbP05622 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PdgfrbP05622 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PdgfrbP05622 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PdgfrbP05622 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PdgfrbP05622 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PdgfrbP05622 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PdgfrbP05622 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PdgfrbP05622 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PdgfrbP05622 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PdgfrbP05622 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PdgfrbP05622 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PdgfrbP05622 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PdgfrbP05622 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PdgfrbP05622 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PdgfrbP05622 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PdgfrbP05622 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PdgfrbP05622 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PdgfrbP05622 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PdgfrbP05622 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PdgfrbP05622 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PdgfrbP05622 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PdgfrbP05622 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PdgfrbP05622 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PdgfrbP05622 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PdgfrbP05622 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PdgfrbP05622 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PdgfrbP05622 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PdgfrbP05622 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PdgfrbP05622 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PdgfrbP05622 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PdgfrbP05622 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PdgfrbP05622 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PdgfrbP05622 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PdgfrbP05622 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PdgfrbP05622 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PdgfrbP05622 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PdgfrbP05622 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PdgfrbP05622 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PdgfrbP05622 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PdgfrbP05622 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PdgfrbP05622 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PdgfrbP05622 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PdgfrbP05622 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PdgfrbP05622 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PdgfrbP05622 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PdgfrbP05622 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PdgfrbP05622 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PdgfrbP05622 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PdgfrbP05622 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PdgfrbP05622 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PdgfrbP05622 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PdgfrbP05622 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PdgfrbP05622 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PdgfrbP05622 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PdgfrbP05622 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PdgfrbP05622 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PdgfrbP05622 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PdgfrbP05622 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PdgfrbP05622 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PdgfrbP05622 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PdgfrbP05622 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PdgfrbP05622 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PdgfrbP05622 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PdgfrbP05622 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PdgfrbP05622 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PdgfrbP05622 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PdgfrbP05622 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PdgfrbP05622 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PdgfrbP05622 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PdgfrbP05622 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PdgfrbP05622 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PdgfrbP05622 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PdgfrbP05622 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PdgfrbP05622 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PdgfrbP05622 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PdgfrbP05622 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PdgfrbP05622 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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